R語言繪制數(shù)據(jù)可視化Dumbbell?plot啞鈴圖

更新時間：2022年02月17日 08:34:12 作者：黃小仙

這篇文章主要為大家介紹了R語言繪制數(shù)據(jù)可視化Dumbbell?plot啞鈴圖的實(shí)現(xiàn)步驟詳解，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進(jìn)步

Step1. 繪圖數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備

首先要把你想要繪圖的數(shù)據(jù)調(diào)整成R語言可以識別的格式，建議大家在excel中保存成csv格式。
作圖數(shù)據(jù)格式如下：

Step2. 繪圖數(shù)據(jù)的讀取

data <- read.csv(“your file path”, header = T, check.names=F)
#注釋：header=T表示數(shù)據(jù)中的第一行是列名，如果沒有列名就用header=F
#注釋：R讀取數(shù)據(jù)的時候，默認(rèn)會把列名里的空格變成 "."，check.names=F就不會變了

Step3. 繪圖所需package的安裝、調(diào)用

library(ggplot2) 
library(reshape2)              
# 注釋：package使用之前需要調(diào)用

Step4. 繪圖

data_melt <- melt(data,id.vars = "Gene")
# 注釋：將原始的寬數(shù)據(jù)變成長數(shù)據(jù)，方便畫圖
p <- ggplot(data_melt,aes(x = value, y = Gene)) +  
       geom_line(aes(group = Gene)) +
       geom_point(aes(fill = variable), size = 3)
p

注意改變點(diǎn)顏色的語句fill = variable沒有發(fā)揮作用，為什么呢？

還是跟geom_point()中的shape有關(guān)系，默認(rèn)是16號實(shí)心原點(diǎn)，只有color參數(shù)

p <- ggplot(data_melt,aes(x= value, y= Gene)) +  
  geom_line(aes(group = Gene)) +
  geom_point(aes(color = variable), size = 3)
p

改變size的大小

p <- ggplot(data_melt,aes(x= value, y= Gene)) +  
  geom_line(aes(group = Gene)) +
  geom_point(aes(color = variable, size = value))
p

調(diào)整順序

order <- c("Gene1","Gene2","Gene3","Gene4","Gene5","Gene6","Gene7","Gene8","Gene9","Gene10")
p <- ggplot(data_melt,aes(x= value, y= Gene)) +  
  geom_line(aes(group = Gene)) +
  geom_point(aes(fill=variable), shape = 21, size = 3) +
  scale_y_discrete(limits = order)
p

Gene1放在y軸最上面

order <- rev(order)
p <- ggplot(data_melt,aes(x= value, y= Gene)) +  
  geom_line(aes(group = Gene)) +
  geom_point(aes(fill=variable), shape = 21, size = 3) +
  scale_y_discrete(limits = order)
p