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R語言繪制Facet violin plot小提琴刻面圖實現(xiàn)示例

 更新時間:2022年02月18日 10:10:36   作者:黃小仙  
這篇文章主要為大家介紹了R語言繪制Facet violin plot小提琴刻面圖的實現(xiàn)示例,有需要的朋友可以借鑒參考下,希望能夠有所幫助,祝大家多多進步

老鐵們,許久未見啦。順便說一下,最近可不是小仙同學偷懶喲,電腦上個月送修今天剛剛拿回來(想買聯(lián)想Yoga的同學先問問自己會不會拆電腦換排線,我買的這臺用了一個月,送修也用了一個月 )。
最近我可攢了個大招呢,先來看看下面這張圖,有沒有很眼熟呢?

在這里插入圖片描述

這張圖在開始介紹R語言的時候就出現(xiàn)過啦,不過小仙同學當時并不知道怎么畫。今天可以秀一把啦。

Step1. 繪圖數據的準備

老樣子,準備好要作圖的csv文件。
數據的格式如下圖:列表示一種變量(特征),第一行是列名
a1~a9表示9種基因,TypeA~TypeC表示三種不同的細胞

在這里插入圖片描述

Step2. 繪圖數據的讀取

data<-read.csv(“your file path”, header = T)    #注釋:header=T表示數據中      
                                的第一行是列名,如果沒有列名就用header=F

Step3.繪圖所需package的安裝、調用

#注釋:大家要注意今天要用的package安裝比較特別喲
install.packages("devtools")                  
library(devtools) 
install_github("kassambara/easyGgplot2")
library(easyGgplot2)
#注釋:今天還要用到一個新的函數,reshape2里的melt函數,可以把寬數據變成長數據 
install.package("reshape2")  
library(reshape2)
df<-melt(data,id.vars = c("type"))

Step4. 繪圖

ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',         #注釋:xName表示x軸變量,yName表示y軸變量
                   groupName='variable', legendPosition="top",
                   faceting=TRUE,facetingVarNames="type")

在這里插入圖片描述

Step5.美化

ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value',
                   groupName='variable', legendPosition="top",
                   backgroundColor="white",
                   removePanelGrid=TRUE,
                   axisLine=c(0.5, "solid", "black"),
                   faceting=TRUE, facetingVarNames="type")

在這里插入圖片描述

在這里插入圖片描述

Ps:如果想去掉邊框可以加上這一句removePanelBorder=TRUE

到這里已經可以完成facet violin plot了,那么問題來了,怎么才能讓圖片變成下圖這個樣子呢?小仙同學用了個很笨的方法,下次分享揭曉答案喲!

在這里插入圖片描述

以上就是R語言繪制Facet violin plot小提琴刻面圖實現(xiàn)示例的詳細內容,更多關于R語言繪制Facet violin plot小提琴刻面圖的資料請關注腳本之家其它相關文章!

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