R語言繪制Facet violin plot小提琴刻面圖實現(xiàn)示例
老鐵們,許久未見啦。順便說一下,最近可不是小仙同學偷懶喲,電腦上個月送修今天剛剛拿回來(想買聯(lián)想Yoga的同學先問問自己會不會拆電腦換排線,我買的這臺用了一個月,送修也用了一個月 )。
最近我可攢了個大招呢,先來看看下面這張圖,有沒有很眼熟呢?
這張圖在開始介紹R語言的時候就出現(xiàn)過啦,不過小仙同學當時并不知道怎么畫。今天可以秀一把啦。
Step1. 繪圖數據的準備
老樣子,準備好要作圖的csv文件。
數據的格式如下圖:列表示一種變量(特征),第一行是列名
a1~a9表示9種基因,TypeA~TypeC表示三種不同的細胞
Step2. 繪圖數據的讀取
data<-read.csv(“your file path”, header = T) #注釋:header=T表示數據中 的第一行是列名,如果沒有列名就用header=F
Step3.繪圖所需package的安裝、調用
#注釋:大家要注意今天要用的package安裝比較特別喲 install.packages("devtools") library(devtools) install_github("kassambara/easyGgplot2") library(easyGgplot2) #注釋:今天還要用到一個新的函數,reshape2里的melt函數,可以把寬數據變成長數據 install.package("reshape2") library(reshape2) df<-melt(data,id.vars = c("type"))
Step4. 繪圖
ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value', #注釋:xName表示x軸變量,yName表示y軸變量 groupName='variable', legendPosition="top", faceting=TRUE,facetingVarNames="type")
Step5.美化
ggplot2.violinplot(data=df,xName='variable',yName='value', groupName='variable', legendPosition="top", backgroundColor="white", removePanelGrid=TRUE, axisLine=c(0.5, "solid", "black"), faceting=TRUE, facetingVarNames="type")
Ps:如果想去掉邊框可以加上這一句removePanelBorder=TRUE
到這里已經可以完成facet violin plot了,那么問題來了,怎么才能讓圖片變成下圖這個樣子呢?小仙同學用了個很笨的方法,下次分享揭曉答案喲!
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