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R語言繪圖學(xué)習(xí)教程VennDiagram繪制venn

 更新時間：2022年06月24日 09:48:17   作者：小白菜學(xué)生信  
這篇文章主要為大家介紹了R語言繪圖學(xué)習(xí)教程VennDiagram繪制venn的示例詳解，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進步，早日升職加薪

導(dǎo)讀

使用VennDiagram函數(shù)包中的venn.diagram函數(shù)繪制三數(shù)據(jù)集venn圖。

安裝依賴包：

# venn圖
install.packages("VennDiagram")
library(VennDiagram)

一、模擬輸入

產(chǎn)生3個含200字符串的數(shù)據(jù)集

set1 <- paste(rep("word_" , 200) , sample(c(1:1000) , 200 , replace=F) , sep="")
set2 <- paste(rep("word_" , 200) , sample(c(1:1000) , 200 , replace=F) , sep="")
set3 <- paste(rep("word_" , 200) , sample(c(1:1000) , 200 , replace=F) , sep="")
set4 <- paste(rep("word_" , 200) , sample(c(1:1000) , 200 , replace=F) , sep="")
set5 <- paste(rep("word_" , 200) , sample(c(1:1000) , 200 , replace=F) , sep="")

sample(x, size, replace=F) # 不放回抽樣

二、venn基礎(chǔ)圖

1 兩個圈

venn.diagram(
  x = list(set1, set2),
  category.names = c("Set 1" , "Set 2 "),
  filename = 'venn.png',
  output=TRUE
)

2 三個圈

venn.diagram(
  x = list(set1, set2, set3),
  category.names = c("Set 1" , "Set 2 " , "Set 3"),
  filename = 'venn.png',
  output=TRUE
)

3 四個圈

venn.diagram(
  x = list(set1, set2, set3, set4),
  category.names = c("Set 1" , "Set 2 " , "Set 3", "Set 4"),
  filename = 'venn.png',
  output=TRUE
)

4 五個圈

venn.diagram(
  x = list(set1, set2, set3, set4, set5),
  category.names = c("Set 1" , "Set 2 " , "Set 3", "Set 4", "Set 5"),
  filename = 'venn.png',
  output=TRUE
)

三、個性化參數(shù)調(diào)整

library(RColorBrewer)
color <- brewer.pal(3, "Set3")
# Chart
venn.diagram(
        x = list(set1, set2, set3),
        category.names = c("Set 1" , "Set 2 " , "Set 3"),
        filename = 'venn2.png',
        output=TRUE,
        # 輸出
        imagetype="png" ,  # 類型（tiff png svg）
        #height = 1000 ,   # 高度
        #width = 1000 ,   # 寬度
        resolution = 400,  # 分辨率
        compression = "lzw",  # 壓縮算法
        # 圈
        lwd = 5,  # 圈線條粗細 1 2 3 4 5
        lty = 1,  # 線條類型, 1 實線, 2 虛線, blank 無線條
        fill = color,  # 填充色
        col = c("red", 'green', 'blue'),  # 線條色
        # 數(shù)字 number
        cex = 2,  # 數(shù)字大小
        fontface = "bold",  # 加粗
        fontfamily = "sans",  # 字體
        # 標簽 category
        cat.cex = 2,  # 字體大小
        cat.col = c("red", 'green', 'blue'),  # 字體色
        cat.fontface = "bold",  # 加粗
        cat.default.pos = "outer",  # 位置, outer 內(nèi) text 外
        cat.pos = c(-27, 27, 135),  # 位置，用圓的度數(shù)
        cat.dist = c(0.055, 0.055, 0.085),  # 位置，離圓的距離
        cat.fontfamily = "sans",  # 字體
        rotation = 1  # 1 2 3 旋轉(zhuǎn)確定大打頭數(shù)據(jù)集
)

四、保存

1 繪圖待保存

library(RColorBrewer)
p = venn.diagram(
  x = list(set1, set2, set3, set4, set5),
  category.names = c("Set 1" , "Set 2 " , "Set 3", "Set 4", "Set 5"),
  # filename = 'venn.png',
  filename = NULL,
  output=TRUE,
  fill = brewer.pal(5, "Set2"),
  col = brewer.pal(5, "Set3"),
  fontface = "bold",
  cat.col = brewer.pal(5, "Set3"),
  cat.fontface = "bold"
)

2 保存為PDF

pdf("venn-pdf.pdf")
grid.draw(p)
dev.off()

3 保存為PNG

png("venn-png.png")
grid.draw(p)
dev.off()

更多參數(shù)：

col = NA  # 邊框設(shè)為無色

參考：

https://r-graph-gallery.com/venn-diagram.html

venn網(wǎng)頁工具：

http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

enn.diagram函數(shù)文檔:

https://www.rdocumentation.org/packages/VennDiagram/versions/1.6.20/topics/venn.diagram

以上就是R語言繪圖學(xué)習(xí)教程VennDiagram繪制venn的詳細內(nèi)容，更多關(guān)于R語言VennDiagram繪制venn的資料請關(guān)注腳本之家其它相關(guān)文章！

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