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R語(yǔ)言ggplot2繪圖安裝與調(diào)試

 更新時(shí)間:2023年06月13日 08:20:05   作者:ytcboy  
ggplot2是R語(yǔ)言中最常用的繪圖包之一,它提供了一種基于圖層的繪圖語(yǔ)法,使得用戶可以輕松地創(chuàng)建高質(zhì)量的數(shù)據(jù)可視化圖表。在使用ggplot2之前,需要先安裝該包并進(jìn)行調(diào)試。安裝ggplot2可以通過(guò)CRAN或GitHub進(jìn)行,調(diào)試則需要注意數(shù)據(jù)格式、語(yǔ)法錯(cuò)誤等問(wèn)題。

0x01 安裝與R基礎(chǔ)

一直聽(tīng)說(shuō)數(shù)據(jù)分析里R語(yǔ)言是比較‘正統(tǒng)’,況且久聞ggplot2這些R語(yǔ)言的數(shù)據(jù)分析庫(kù)大名,想到今后數(shù)據(jù)分析和整理的需要,這里開(kāi)一個(gè)簡(jiǎn)單的系列學(xué)習(xí)一些R語(yǔ)言和ggplot2的繪圖基礎(chǔ)。本人學(xué)習(xí)的書(shū)籍是Winston Chang大佬的《R Graphics Cookbook》,且稍有一點(diǎn)Python里的Plotnine繪圖基礎(chǔ)。但我算是R語(yǔ)言小白,所以整個(gè)系列也可以記錄自己學(xué)習(xí)遇到的坑,供大家參考。

庫(kù)安裝

我使用的R版本為3.6.3,需要下載的庫(kù)包括ggplot2,gcookbook和dplyr庫(kù)??梢允褂萌缦碌陌惭b指令:

install.packages("ggplo2")
install.packages("dplyr")
install.packages("gcookbook")

如果遇到了installation of package ‘ggplot2’ had non-zero exit status類似的問(wèn)題,可以指定安裝程序強(qiáng)制安裝二進(jìn)制文件[1],如

install.packages("ggplo2", type = "binary") 

R語(yǔ)言數(shù)據(jù)處理基礎(chǔ)

首先簡(jiǎn)單介紹數(shù)據(jù)輸入常用的兩種方法,一種是CSV數(shù)據(jù),我們可以采用函數(shù)read.csv(file, args)輸入;另一種常用數(shù)據(jù)EXCEL數(shù)據(jù)可以使用read_excel(file)函數(shù)輸入數(shù)據(jù)。

dplyr包(magrittr包)提供了一種運(yùn)算符%>%,可以在R中實(shí)現(xiàn)類似連續(xù)函數(shù)調(diào)用的編程方法,以嵌套函數(shù)f,g,h為例:

h(g(f(x)))
# 等價(jià)于
x %>% 
  f() %>% 
  g() %>% 
  h()

這樣的函數(shù)調(diào)用相比嵌套函數(shù)更加直觀,尤其是在多個(gè)連續(xù)的數(shù)據(jù)集處理場(chǎng)合。

基礎(chǔ)繪圖以及概念

散點(diǎn)圖和完整流程

繪制圖片使用的數(shù)據(jù)集為mtcars:

mtcars %>% head() 
                   mpg cyl disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Mazda RX4         21.0   6  160 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
Mazda RX4 Wag     21.0   6  160 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
Datsun 710        22.8   4  108  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
Hornet 4 Drive    21.4   6  258 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
Hornet Sportabout 18.7   8  360 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
Valiant           18.1   6  225 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1

在開(kāi)始繪圖之前,有一點(diǎn)基本的R語(yǔ)言基礎(chǔ)設(shè)施需要準(zhǔn)備。R語(yǔ)言畫(huà)圖需要有基礎(chǔ)的畫(huà)布,可以用dev.new()函數(shù)來(lái)開(kāi)啟一個(gè)新的畫(huà)布(如果是windows系統(tǒng)需要使用windows()函數(shù))。

dev.new()
# windows() # windows系統(tǒng)使用

下面直接展示最簡(jiǎn)單的散點(diǎn)圖繪制代碼:

p <- ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) +
  geom_point()

上面的代碼就是一個(gè)使用ggplot2繪圖的最基本結(jié)構(gòu),ggplot函數(shù)是保存數(shù)據(jù)集和映射信息(aes)等基本信息的繪圖主函數(shù),也可以理解為存儲(chǔ)所有信息的畫(huà)布底層。第一個(gè)參數(shù)放入數(shù)據(jù)集,后續(xù)的映射都在此數(shù)據(jù)集上進(jìn)行,本例中就是使用了mtcars中的wt列作為x,mpg列作為y值。ggplot2中的函數(shù)基本均是加法進(jìn)行組合,所以這里加上了geom_point函數(shù)組合進(jìn)繪圖。此時(shí)geom_point函數(shù)通過(guò)ggplot函數(shù)可以得知其繪圖需要用到的鍵信息(x, y)分別對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)值。代碼運(yùn)行結(jié)果如下:

繪制完圖后,可以選擇print(p)來(lái)查看圖片并保存,或者使用ggplot2自帶的函數(shù)ggsave來(lái)保存圖片,基本的格式例如png,pdf等都有[2]。

ggsave(p, "p.png") 

如果想要繪圖的數(shù)據(jù)不屬于同一個(gè)data frame,那么可以不指定ggplot函數(shù)的數(shù)據(jù)項(xiàng),在aes映射中直接定義,如下所示:

ggplot(data=null, aes(x = mtcars$wt, y = mtcars$mpg)) 

其他基本繪圖與基礎(chǔ)

下面的代碼展示了R語(yǔ)言繪制線形圖的基本函數(shù)geom_line,同時(shí)展示了ggplot2通過(guò)組合函數(shù)geom_line和geom_point來(lái)繪圖的基本邏輯:

p <- ggplot(pressure, aes(x = temperature, y = pressure)) +
  geom_line() +
  geom_point()

對(duì)于柱形圖,ggplot2的相關(guān)支持比較多,這里展示最基礎(chǔ)的兩種,一個(gè)是geom_bar函數(shù):

p <- ggplot(mtcars, aes(x = factor(cyl))) +
  geom_bar()

這里有一個(gè)新的函數(shù)factor,這個(gè)函數(shù)是將數(shù)據(jù)列變化為因子,體現(xiàn)在圖上類似于將連續(xù)變量轉(zhuǎn)化為了離散的變量??梢钥吹?,上述的映射信息中不包括y值。這是因?yàn)間eom_bar函數(shù)默認(rèn)的運(yùn)作方式count,也就是統(tǒng)計(jì)x的出現(xiàn)次數(shù)并繪圖,相當(dāng)于geom_bar(stat="count"),其中stat選項(xiàng)是統(tǒng)計(jì)函數(shù)的意思。如果需要繪制具體數(shù)值類似y值的柱形圖就需要用到下一個(gè)函數(shù)了。
第二個(gè)柱形圖的函數(shù)是geom_col函數(shù):

p <- ggplot(BOD, aes(x = factor(Time), y = demand)) +
  geom_col()

其實(shí)geom_col的效果與geom_bar(stat="identity")是一致的,這樣就能隨心所欲的繪制柱形圖了。

下面的代碼示例展示了繪制和柱形圖很像的直方圖的案例:

p <- ggplot(mtcars, aes(x = mpg)) +
  geom_histogram(binwidth = 3)

直方圖也是默認(rèn)的頻率統(tǒng)計(jì),這里略微調(diào)整了參數(shù)binwidth來(lái)放大每個(gè)直方的寬度。

下面的代碼展示了如何繪制箱型圖的例子:

p <- ggplot(ToothGrowth, aes(x = interaction(supp, dose), y = len)) +
  geom_boxplot()

上面除了基本代碼還用到了interaction函數(shù),用于組合變量,類似cross join的結(jié)果。

除開(kāi)這些基本繪圖,數(shù)學(xué)函數(shù)的繪制也比較容易:

# 自定義函數(shù)
myfun <- function(xvar) {
  1 / (1 + exp(-xvar + 10))
}

p <- ggplot(data.frame(xdata = c(0, 20)), aes(x = xdata)) +
stat_function(fun = myfun, geom = "line")

上面的代碼首先定義了一個(gè)簡(jiǎn)單的函數(shù),然后將函數(shù)作為自定義統(tǒng)計(jì)函數(shù)stat_function的fun參數(shù)輸入,并選擇繪圖方式為line,這樣就可以得到一條函數(shù)曲線。 總結(jié)

本節(jié)主旨在于R語(yǔ)言ggplot2繪圖的初探,熟悉基本的繪圖模式。后續(xù)將會(huì)一一展開(kāi)學(xué)習(xí)庫(kù)中的繪圖細(xì)節(jié),完善繪圖質(zhì)量。

ggplot2是R語(yǔ)言中最常用的繪圖包之一,使用前需要進(jìn)行安裝和調(diào)試。初學(xué)者可以通過(guò)學(xué)習(xí)ggplot2教程來(lái)更好地理解其繪圖語(yǔ)法和使用方法。掌握ggplot2可以幫助用戶輕松地創(chuàng)建高質(zhì)量的數(shù)據(jù)可視化圖表。

參考資料:

[1] 解決R包“had non-zero exit status”安裝報(bào)錯(cuò)。
[2] ggplot2圖片保存

到此這篇關(guān)于R語(yǔ)言ggplot2繪圖安裝與調(diào)試的文章就介紹到這了,更多相關(guān)R語(yǔ)言ggplot2繪圖安裝內(nèi)容請(qǐng)搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章希望大家以后多多支持腳本之家!

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