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Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法

 更新時(shí)間：2019年01月24日 09:11:20   作者：Darlewo  
今天小編就為大家分享一篇Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法，具有很好的參考價(jià)值，希望對(duì)大家有所幫助。一起跟隨小編過來(lái)看看吧

mhd格式的文件里面包含的是raw圖像的一些頭信息,比如圖片大小，拍攝日期等等，那么如何可視化圖像呢？

import cv2
import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
image =sitk.ReadImage(path)
image = sitk.GetArrayFromImage(image)
#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer
plt.imshow(image,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()
cv2.imwrite('1.png',image)

這里path是mhd文件的路徑，并且在該路徑下需要有相應(yīng)的raw文件

這里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存

Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存

在這里如果cv2和ITK模塊沒有的話可以用pip安裝

pip install opencv-python 
pip install SimpleITK

以上這篇Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法就是小編分享給大家的全部?jī)?nèi)容了，希望能給大家一個(gè)參考，也希望大家多多支持腳本之家。

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