Ubuntu+python將nii圖像保存成png格式
更新時間：2019年07月18日 15:00:54 作者：無寵不驚過一生
這篇文章主要介紹了Ubuntu+python將nii圖像保存成png格式，文中通過示例代碼介紹的非常詳細，對大家的學習或者工作具有一定的參考學習價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學習學習吧
這里介紹一個nii文件保存為png格式的方法。
這篇文章是介紹多個nii文件保存為png格式的方法：
http://www.dbjr.com.cn/article/165692.htm
系統(tǒng)：Ubuntu 16.04
軟件： python 3.5
先用pip安裝nibabel、numpy、imageio、os。
import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
def read_niifile(niifile): #讀取niifile文件
img = nib.load(niifile) #下載niifile文件（其實是提取文件）
img_fdata = img.get_fdata() #獲取niifile數(shù)據(jù)
return img_fdata
def save_fig(file): #保存為圖片
fdata = read_niifile(file) #調(diào)用上面的函數(shù)，獲得數(shù)據(jù)
(x,y,z) = fdata.shape #獲得數(shù)據(jù)shape信息：（長，寬，維度-切片數(shù)量）
for k in range(z):
silce = fdata[k,:,:] #三個位置表示三個不同角度的切片
imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
#將切片信息保存為png格式
dir = './.nii' #nii的路徑
savepicdir = '' #保存png的路徑
os.mkdir(savepicdir) #創(chuàng)建文件夾
save_fig(dir) #運行程序，保存為圖像
不要忘記返回img_fdata，否則下一個文件會報錯。
以上就是本文的全部內(nèi)容，希望對大家的學習有所幫助，也希望大家多多支持腳本之家。
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