解決Keras中循環(huán)使用K.ctc_decode內(nèi)存不釋放的問題
如下一段代碼,在多次調(diào)用了K.ctc_decode時,會發(fā)現(xiàn)程序占用的內(nèi)存會越來越高,執(zhí)行速度越來越慢。
data = generator(...) model = init_model(...) for i in range(NUM): x, y = next(data) _y = model.predict(x) shape = _y.shape input_length = np.ones(shape[0]) * shape[1] ctc_decode = K.ctc_decode(_y, input_length)[0][0] out = K.get_value(ctc_decode)
原因
每次執(zhí)行ctc_decode時都會向計算圖中添加一個節(jié)點,這樣會導致計算圖逐漸變大,從而影響計算速度和內(nèi)存。
PS:有資料說是由于get_value導致的,其中也給出了解決方案。
但是我將ctc_decode放在循環(huán)體之外就不再出現(xiàn)內(nèi)存和速度問題,這是否說明get_value影響其實不大呢?
解決方案
通過K.function封裝K.ctc_decode,只需初始化一次,只向計算圖中添加一個計算節(jié)點,然后多次調(diào)用該節(jié)點(函數(shù))
data = generator(...) model = init_model(...) x = model.output # [batch_sizes, series_length, classes] input_length = KL.Input(batch_shape=[None], dtype='int32') ctc_decode = K.ctc_decode(x, input_length=input_length * K.shape(x)[1]) decode = K.function([model.input, input_length], [ctc_decode[0][0]]) for i in range(NUM): _x, _y = next(data) out = decode([_x, np.ones(1)])
補充知識:CTC_loss和CTC_decode的模型封裝代碼避免節(jié)點不斷增加
該問題可以參考上面的描述,無論是CTC_decode還是CTC_loss,每次運行都會創(chuàng)建節(jié)點,避免的方法是將其封裝到model中,這樣就固定了計算節(jié)點。
測試方法: 在初始化節(jié)點后(注意是在運行fit/predict至少一次后,因為這些方法也會更改計算圖狀態(tài)),運行K.get_session().graph.finalize()鎖定節(jié)點,此時如果圖節(jié)點變了會報錯并提示出錯代碼。
from keras import backend as K
from keras.layers import Lambda,Input
from keras import Model
from tensorflow.python.ops import ctc_ops as ctc
import tensorflow as tf
from keras.layers import Layer
class CTC_Batch_Cost():
'''
用于計算CTC loss
'''
def ctc_lambda_func(self,args):
"""Runs CTC loss algorithm on each batch element.
# Arguments
y_true: tensor `(samples, max_string_length)` 真實標簽
y_pred: tensor `(samples, time_steps, num_categories)` 預測前未經(jīng)過softmax的向量
input_length: tensor `(samples, 1)` 每一個y_pred的長度
label_length: tensor `(samples, 1)` 每一個y_true的長度
# Returns
Tensor with shape (samples,1) 包含了每一個樣本的ctc loss
"""
y_true, y_pred, input_length, label_length = args
# y_pred = y_pred[:, :, :]
# y_pred = y_pred[:, 2:, :]
return self.ctc_batch_cost(y_true, y_pred, input_length, label_length)
def __call__(self, args):
'''
ctc_decode 每次創(chuàng)建會生成一個節(jié)點,這里參考了上面的內(nèi)容
將ctc封裝成模型,是否會解決這個問題還沒有測試過這種方法是否還會出現(xiàn)創(chuàng)建節(jié)點的問題
'''
y_true = Input(shape=(None,))
y_pred = Input(shape=(None,None))
input_length = Input(shape=(1,))
label_length = Input(shape=(1,))
lamd = Lambda(self.ctc_lambda_func, output_shape=(1,), name='ctc')([y_true,y_pred,input_length,label_length])
model = Model([y_true,y_pred,input_length,label_length],[lamd],name="ctc")
# return Lambda(self.ctc_lambda_func, output_shape=(1,), name='ctc')(args)
return model(args)
def ctc_batch_cost(self,y_true, y_pred, input_length, label_length):
"""Runs CTC loss algorithm on each batch element.
# Arguments
y_true: tensor `(samples, max_string_length)`
containing the truth labels.
y_pred: tensor `(samples, time_steps, num_categories)`
containing the prediction, or output of the softmax.
input_length: tensor `(samples, 1)` containing the sequence length for
each batch item in `y_pred`.
label_length: tensor `(samples, 1)` containing the sequence length for
each batch item in `y_true`.
# Returns
Tensor with shape (samples,1) containing the
CTC loss of each element.
"""
label_length = tf.to_int32(tf.squeeze(label_length, axis=-1))
input_length = tf.to_int32(tf.squeeze(input_length, axis=-1))
sparse_labels = tf.to_int32(K.ctc_label_dense_to_sparse(y_true, label_length))
y_pred = tf.log(tf.transpose(y_pred, perm=[1, 0, 2]) + 1e-7)
# 注意這里的True是為了忽略解碼失敗的情況,此時loss會變成nan直到下一個個batch
return tf.expand_dims(ctc.ctc_loss(inputs=y_pred,
labels=sparse_labels,
sequence_length=input_length,
ignore_longer_outputs_than_inputs=True), 1)
# 使用方法:(注意shape)
loss_out = CTC_Batch_Cost()([y_true, y_pred, audio_length, label_length])
from keras import backend as K
from keras.layers import Lambda,Input
from keras import Model
from tensorflow.python.ops import ctc_ops as ctc
import tensorflow as tf
from keras.layers import Layer
class CTCDecodeLayer(Layer):
def __init__(self, **kwargs):
super().__init__(**kwargs)
def _ctc_decode(self,args):
base_pred, in_len = args
in_len = K.squeeze(in_len,axis=-1)
r = K.ctc_decode(base_pred, in_len, greedy=True, beam_width=100, top_paths=1)
r1 = r[0][0]
prob = r[1][0]
return [r1,prob]
def call(self, inputs, **kwargs):
return self._ctc_decode(inputs)
def compute_output_shape(self, input_shape):
return [(None,None),(1,)]
class CTCDecode():
'''用與CTC 解碼,得到真實語音序列
2019年7月18日所寫,對ctc_decode使用模型進行了封裝,從而在初始化完成后不會再有新節(jié)點的產(chǎn)生
'''
def __init__(self):
base_pred = Input(shape=[None,None],name="pred")
feature_len = Input(shape=[1,],name="feature_len")
r1, prob = CTCDecodeLayer()([base_pred,feature_len])
self.model = Model([base_pred,feature_len],[r1,prob])
pass
def ctc_decode(self,base_pred,in_len,return_prob = False):
'''
:param base_pred:[sample,timestamp,vector]
:param in_len: [sample,1]
:return:
'''
result,prob = self.model.predict([base_pred,in_len])
if return_prob:
return result,prob
return result
def __call__(self,base_pred,in_len,return_prob = False):
return self.ctc_decode(base_pred,in_len,return_prob)
# 使用方法:(注意shape,是batch級的輸入)
ctc_decoder = CTCDecode()
ctc_decoder.ctc_decode(result,feature_len)
以上這篇解決Keras中循環(huán)使用K.ctc_decode內(nèi)存不釋放的問題就是小編分享給大家的全部內(nèi)容了,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。
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