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.img/.hdr格式轉(zhuǎn).nii格式的操作

 更新時間：2020年07月01日 10:40:08   作者：咸魚醬  
這篇文章主要介紹了.img/.hdr格式轉(zhuǎn).nii格式的操作，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧

MATLAB轉(zhuǎn)格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).

%%img2nii.m--------------------------------------------
%Script to convert hdr/img files to nii.
%This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later.
%Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014
 
%select files
f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted');
 
%convert img files to nii
for i=1:size(f,1)
 input = deblank(f(i,:));
 [pathstr,fname,ext] = fileparts(input);
 output = strcat(fname,'.nii');
 V=spm_vol(input);
 ima=spm_read_vols(V);
 V.fname=output;
 spm_write_vol(V,ima);
end

附加一下volume data是如何轉(zhuǎn)surface data的吧…

wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear

補(bǔ)充知識：數(shù)據(jù)讀取——（.img .hdr）

1、定義

該圖像格式含有兩部分：一個是圖像 ‘.img '，另一個是圖像頭文件 '.hdr'，該文件記錄了圖像的信息，如圖像尺寸、波段數(shù)、數(shù)據(jù)類型和大小端等。如果缺少頭文件，將無法對圖像進(jìn)行讀取，因此頭文件十分重要。

2、讀取

使用Matlab中NifTi包讀取。

eg：

img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')

以上這篇.img/.hdr格式轉(zhuǎn).nii格式的操作就是小編分享給大家的全部內(nèi)容了，希望能給大家一個參考，也希望大家多多支持腳本之家。

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