使用python操作lmdb對(duì)數(shù)據(jù)讀取的實(shí)例
由于c++速度快,所以一般寫(xiě)入數(shù)據(jù)我調(diào)用c++借口,而讀取數(shù)據(jù)使用c++也行,但有時(shí)候Python在某方面方便,所以通過(guò)使用python借口僅僅對(duì)lmdb文件讀取,處理數(shù)據(jù)是圖片
import lmdb import numpy as np import cv2 lmdb_file = "/home/rui/demo" lmdb_env = lmdb.open(lmdb_file) lmdb_txn = lmdb_env.begin() lmdb_cursor = lmdb_txn.cursor() for key, value in lmdb_cursor: img = cv2.imdecode(np.fromstring(value, np.uint8), 3); cv2.imshow("demo", img) cv2.waitKey(0)
補(bǔ)充知識(shí):Python解析lmdb格式mnist數(shù)據(jù)集
背景
HDF5和LMDB都是Cafffe中常用的數(shù)據(jù)庫(kù)。相對(duì)來(lái)說(shuō),HDF5的讀寫(xiě)格式簡(jiǎn)單;LMDB采用內(nèi)存-映射文件(memory-mapped files),所以擁有非常好的I/O性能,而且對(duì)于大型數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)說(shuō),HDF5的文件常常整個(gè)寫(xiě)入內(nèi)存。
所以HDF5的文件大小就受限于內(nèi)存大小,當(dāng)然也可以通過(guò)文件分割來(lái)解決問(wèn)題,但其I/O性能就不如LMDB的頁(yè)緩存(page cachiing)策略了。
MNIST手寫(xiě)數(shù)字字符識(shí)別實(shí)驗(yàn)在deep learning 中經(jīng)常用到,這里使用Python來(lái)獲取lmdb格式MNIST數(shù)據(jù)集中的圖片并顯示出來(lái)
Python讀取LMDB
首先確認(rèn)你安裝了lmdb和Caffe的python包(Caffe中的pycaffe)。
pip install lmdb
LMDB采用鍵值對(duì)的存儲(chǔ)格式,key就是字符形式的ID,value是Caffe中Datum類(lèi)的序列化形式。
# -*- coding:utf-8 -*- import caffe from caffe.proto import caffe_pb2 import lmdb import cv2 as cv env = lmdb.open("mnist_train_lmdb", readonly=True) # 打開(kāi)數(shù)據(jù)文件 txn = env.begin() # 生成處理句柄 cur = txn.cursor() # 生成迭代器指針 datum = caffe_pb2.Datum() # caffe 定義的數(shù)據(jù)類(lèi)型 for key, value in cur: print(type(key), key) datum.ParseFromString(value) # 反序列化成datum對(duì)象 label = datum.label data = caffe.io.datum_to_array(datum) print data.shape print datum.channels image = data[0] # image = data.transpose(1, 2, 0) print(type(label)) cv.imshow(str(label), image) cv.waitKey(0) cv.destroyAllWindows() env.close()
運(yùn)行結(jié)果:
讀取LMDB數(shù)據(jù)庫(kù)中的Datum數(shù)據(jù),這里再稍微介紹一下Datum的格式:channels:圖片的通道,彩色圖有3個(gè)通道,灰度圖只有1通道,當(dāng)然也可以用通道數(shù)來(lái)表示其他意思,比如表示兩張圖片,每個(gè)通道一個(gè)單張的圖;height:圖片(即data)的高;width:圖片(即data)的寬;data:圖片的數(shù)據(jù)(像素值);label:圖片的label。(datum.channels, datum.height, datum.width)
以上這篇使用python操作lmdb對(duì)數(shù)據(jù)讀取的實(shí)例就是小編分享給大家的全部?jī)?nèi)容了,希望能給大家一個(gè)參考,也希望大家多多支持腳本之家。
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