Python實現(xiàn)K-means聚類算法并可視化生成動圖步驟詳解
K-means算法介紹
簡單來說,K-means算法是一種無監(jiān)督算法,不需要事先對數(shù)據(jù)集打上標(biāo)簽,即ground-truth,也可以對數(shù)據(jù)集進行分類,并且可以指定類別數(shù)目 牧師-村民模型
K-means 有一個著名的解釋:牧師—村民模型:
有四個牧師去郊區(qū)布道,一開始牧師們隨意選了幾個布道點,并且把這幾個布道點的情況公告給了郊區(qū)所有的村民,于是每個村民到離自己家最近的布道點去聽課。
聽課之后,大家覺得距離太遠(yuǎn)了,于是每個牧師統(tǒng)計了一下自己的課上所有的村民的地址,搬到了所有地址的中心地帶,并且在海報上更新了自己的布道點的位置。
牧師每一次移動不可能離所有人都更近,有的人發(fā)現(xiàn)A牧師移動以后自己還不如去B牧師處聽課更近,于是每個村民又去了離自己最近的布道點……
就這樣,牧師每個禮拜更新自己的位置,村民根據(jù)自己的情況選擇布道點,最終穩(wěn)定了下來。
牧師的目的非常明顯,就是要讓每個來上自己課的村民走的路程最少
算法步驟
- 指定k個中心點
- 更新數(shù)據(jù)點所屬類別:計算每個數(shù)據(jù)點到這k個點的歐氏距離,距離最小即為這個數(shù)據(jù)點的類別
- 更新中心點坐標(biāo):對每一個類別的數(shù)據(jù)點求平均,平均值即為新的中心點位置
偽代碼
獲取m個n維的數(shù)據(jù) 隨即選取k個點作為初始中心點 while keep_changing: for i in range(m): for j in range(k): 計算每個點到center的距離 判斷離哪個點更近 for center in range(k): 更新類別中心點的坐標(biāo)
用Python實現(xiàn)K-means聚類算法
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import sklearn.datasets as datasets def create_data(): X,y = datasets.make_blobs(n_samples=1000,n_features=2,centers=[[1,0],[5,4],[2,3],[10,8],[7,4]]) return X,y def init_centers(data,k): m, n =data.shape # m 樣本個數(shù),n特征個數(shù) center_ids = np.random.choice(m,k) centers = data[center_ids] return centers def cal_dist(ptA,ptB): return np.linalg.norm(ptA-ptB) def kmeans_process(data,k): centers = init_centers(data, k) m, n = data.shape keep_changing = True pred_y = np.zeros((m,)) while keep_changing: keep_changing = False # 計算剩余樣本所屬類別 for i in range(m): min_distance = np.inf for center in range(k): distance = cal_dist(data[i,:],centers[center,:]) if distance<min_distance: # 判斷離哪個更近 min_distance = distance idx = center # 類別換下 if pred_y[i] != idx: # 判斷是否發(fā)生了改變 keep_changing = True pred_y[i] = idx # 更新類別中心點坐標(biāo) for center in range(k): cluster_data = data[pred_y==center] centers[center,:] = np.mean(cluster_data, axis=0) # 求相同類別數(shù)據(jù)點的質(zhì)心點 print(centers) return centers, pred_y if __name__ == '__main__': X, y = create_data() centers , pred_y = kmeans_process(data=X, k=5) plt.scatter(X[:,0], X[:,1], s=3, c=pred_y) plt.scatter(centers[:,0], centers[:,1], s=10, c='k') plt.show()
效果圖
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