快捷導(dǎo)航

R語(yǔ)言入門使用RStudio制作包含Rcpp代碼的R包

更新時(shí)間：2021年11月08日 10:29:36 作者：Kanny廣小隸

這篇文章主要為大家介紹了R語(yǔ)言入門使用RStudio來(lái)制作包含Rcpp代碼的R包，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進(jìn)步

前面博客中有提及，當(dāng)我們進(jìn)行模擬想要再次進(jìn)行提速時(shí)，通常都會(huì)使用Rcpp將我們的R代碼改成C++代碼。具體Rcpp的使用可參考博客：Rcpp入門R代碼提速方法過(guò)程，R語(yǔ)言學(xué)習(xí)RcppEigen進(jìn)行矩陣運(yùn)算。

平時(shí)在我們使用的時(shí)候，直接使用Rcpp::sourceCpp()就可以直接將我們的C++代碼中的函數(shù)進(jìn)行導(dǎo)入，這不會(huì)遇到什么問(wèn)題，但如果我們想要使用snowfall進(jìn)行并行時(shí)就不能再這樣做了。遇到的問(wèn)題在博客中有進(jìn)行說(shuō)明：R中兩種常用并行方法——2. snowfall。

而解決這個(gè)問(wèn)題的有效途徑，就是將我們的Rcpp代碼進(jìn)行打包，然后再對(duì)包進(jìn)行調(diào)用。下面我們就來(lái)介紹：如何使用RStudio制作包含Rcpp代碼的R包。

1. 創(chuàng)建項(xiàng)目

首先我們進(jìn)入RStudio，然后選擇左上角的File—New Project。

新建Project后會(huì)得到如下圖所示的界面，我們接著選New Directory，

再選擇R Package，

最后在得到如下所示的界面后，我們?cè)?code>Package Name中輸入我們包的名稱，然后再在下面選擇Add，將我們的.cpp格式的C++文件選擇進(jìn)去（里面是我們的函數(shù)）。最后點(diǎn)擊Create package，即可創(chuàng)建一個(gè)R包的project了。

創(chuàng)建完之后，RStudio會(huì)彈出一個(gè)新的界面，如下圖所示。

Project

然后我們需要對(duì)下述界面里面的一些配置文件進(jìn)行一定的修改，然后才能完善我們的R包。

2. 修改一些文件

從上面界面的右下角的Files框框中，可以發(fā)現(xiàn)已經(jīng)多出了很多文件，包括DISCRIPTION等文件以及man、R、src三個(gè)文件夾。

在R文件夾中存的是R代碼，src文件夾中是C++代碼（包括我們之前添加的C++代碼）。

可能你的C++代碼中只有添加進(jìn)去.cpp文件，由于我的代碼中不止使用了#include <Rcpp.h>，還有使用#include <RcppEigen.h>，這里注意，一定需要在DISCRIPTION文件的最后添加下面兩行（尤其是LinkingTo，不然會(huì)編譯失?。?/p>

Imports: Rcpp
LinkingTo: Rcpp, RcppEigen

此外還可以在DISCRIPTION文件，添加一些作者姓名等一些重要信息。

DISCRIPTION

直接點(diǎn)開(kāi)DISCRIPTION文件，會(huì)如上圖所示，我們直接進(jìn)行修改即可。這里需要注意一下，Imports里面涉及到軟件的版本，是根據(jù)你R中現(xiàn)有包的版本來(lái)，如果想讓更多的電腦使用，在不影響程序使用的前提下，可以適當(dāng)降低依賴包的版本。