Python使用Numpy實(shí)現(xiàn)Kmeans算法的步驟詳解
Kmeans聚類(lèi)算法介紹:
1.聚類(lèi)概念:
將物理或抽象對(duì)象的集合分成由類(lèi)似的對(duì)象組成的多個(gè)類(lèi)的過(guò)程被稱(chēng)為聚類(lèi)。由聚類(lèi)所生成的簇是一組數(shù)據(jù)對(duì)象的集合,這些對(duì)象與同一個(gè)簇中的對(duì)象彼此相似,與其他簇中的對(duì)象相異。
2.Kmeans算法:
定義:
kmeans算法又名k均值算法,K-means算法中的k表示的是聚類(lèi)為k個(gè)簇,means代表取每一個(gè)聚類(lèi)中數(shù)據(jù)值的均值作為該簇的中心,或者稱(chēng)為質(zhì)心,即用每一個(gè)的類(lèi)的質(zhì)心對(duì)該簇進(jìn)行描述。
大概步驟:
- 設(shè)置初始類(lèi)別中心和類(lèi)別數(shù)
- 根據(jù)類(lèi)別中心對(duì)全部數(shù)據(jù)進(jìn)行類(lèi)別劃分:每個(gè)點(diǎn)分到離自己距離最小的那個(gè)類(lèi)
- 重新計(jì)算當(dāng)前類(lèi)別劃分下每個(gè)類(lèi)的中心:例如可以取每個(gè)類(lèi)別里所有的點(diǎn)的平均值作為新的中心。如何求多個(gè)點(diǎn)的平均值? 分別計(jì)算X坐標(biāo)的平均值,y坐標(biāo)的平均值,從而得到新的點(diǎn)。注意:類(lèi)的中心可以不是真實(shí)的點(diǎn),虛擬的點(diǎn)也不影響。
- 在新的類(lèi)別中心下繼續(xù)進(jìn)行類(lèi)別劃分;
- 如果連續(xù)兩次的類(lèi)別劃分結(jié)果不變則停止算法; 否則循環(huán)2~5。例如當(dāng)類(lèi)的中心不再變化時(shí),跳出循環(huán)。
Kmeans距離測(cè)定方式:
歐式距離:
曼哈頓距離:
余弦相似度:
A與B表示向量(x1,y1),(x2,y2)
分子為A與B的點(diǎn)乘,分母為二者各自的L2相乘,即將所有維度值的平方相加后開(kāi)方。
3.如何確定最佳的k值(類(lèi)別數(shù)):
本文選取手肘法
手肘法:
對(duì)于每一個(gè)k值,計(jì)算它的誤差平方和(SSE):
其中N是點(diǎn)的個(gè)數(shù),Xi 是第i 個(gè)點(diǎn),ci 是Xi 對(duì)應(yīng)的中心。
- 隨著聚類(lèi)數(shù)k的增大,樣本劃分會(huì)更加精細(xì),每個(gè)簇的聚合程度會(huì)逐漸提高,那么誤差平方和SSE自然會(huì)逐漸變小。
- 當(dāng)k小于真實(shí)聚類(lèi)數(shù)時(shí),由于k的增大會(huì)大幅增加每個(gè)簇的聚合程度,故SSE的下降幅度會(huì)很大,而當(dāng)k到達(dá)真實(shí)聚類(lèi)數(shù)時(shí),再增加k所得到的聚合程度回報(bào)會(huì)迅速變小,所以SSE的下降幅度會(huì)驟減,然后隨著k值的繼續(xù)增大而趨于平緩,也就是說(shuō)SSE和k的關(guān)系圖是一個(gè)手肘的形狀,而這個(gè)肘部對(duì)應(yīng)的k值就是數(shù)據(jù)的真實(shí)聚類(lèi)數(shù)
python實(shí)現(xiàn)Kmeans算法:
1.代碼如下:
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import math k = eval(input("請(qǐng)輸入想要?jiǎng)澐值念?lèi)別個(gè)數(shù)")) #規(guī)定類(lèi)別數(shù) n = eval(input("請(qǐng)輸入要循環(huán)的次數(shù)"))#規(guī)定循環(huán)次數(shù) sw = eval(input("請(qǐng)輸入想要查詢(xún)的元素在數(shù)據(jù)中的位置")) def readdata():#獲取data數(shù)據(jù)中坐標(biāo)值 data = np.loadtxt("E:\\Python\\Lab4\\Lab4.dat")#讀取dat數(shù)據(jù) x_data = data[:,0]#橫坐標(biāo) y_data = data[:,1]#縱坐標(biāo) return data,x_data,y_data def init(k):#初始化生成k個(gè)隨機(jī)類(lèi)別中心 data,x_data,y_data = readdata() class_center = [] for i in range(k): #在數(shù)據(jù)的最大值與最小值間給出隨機(jī)值 x = np.random.randint(np.min(x_data),np.max(x_data)) y = np.random.randint(np.min(y_data),np.max(y_data)) class_center.append(np.array([x,y]))#以數(shù)組方式添加,方便后面計(jì)算距離 return class_center def dist(a,b):#計(jì)算兩個(gè)坐標(biāo)間的歐氏距離 dist = math.sqrt(math.pow((a[0] - b[0]),2) + math.pow((a[1] - b[1]),2)) return dist def dist_rank(center,data):#得到與類(lèi)中心最小距離的類(lèi)別位置索引 tem = [] for m in range(k): d = dist(data, center[m]) tem.append(d) loc = tem.index(min(tem)) return loc def means(arr):#計(jì)算類(lèi)的平均值當(dāng)作類(lèi)的新中心 sum_x,sum_y =0,0 for n in arr: sum_x += n[0] sum_y += n[1] mean_x = sum_x / len(arr) mean_y = sum_y / len(arr) return [mean_x,mean_y] def divide(center,data):#將每一個(gè)二維坐標(biāo)分到與之歐式距離最近的類(lèi)里 cla_arr = [[]] for i in range(k-1):#創(chuàng)建與k值相同維度的空數(shù)組存取坐標(biāo) cla_arr.append([]) for j in range(len(data)): loc = dist_rank(center,data[j]) cla_arr[loc].append(list(data[j])) return cla_arr def new_center(cla):#計(jì)算每類(lèi)平均值更新類(lèi)中心 new_cen = [] for g in range(k): new = means(cla[g]) new_cen.append(new) return new_cen def index_element(arr,data,sw):#索引第sw個(gè)元素對(duì)應(yīng)的類(lèi)別 index = [] for i in range(len(data)):#遍歷每一個(gè)數(shù)據(jù) for j in range(k):#遍歷每一個(gè)類(lèi)別 tem = arr[j] for d in range(len(tem)):#遍歷類(lèi)別內(nèi)的每一個(gè)數(shù)據(jù) if data[i][0] == tem[d][0] and data[i][1] == tem[d][1]:#如果橫縱坐標(biāo)數(shù)值都相等 index.append((j + 1))#歸為j+1類(lèi) else: continue return index[sw] def Kmeans(n,sw):#獲取n次更新后類(lèi)別中心以及第sw個(gè)元素對(duì)應(yīng)的類(lèi)別 data, x_data, y_data = readdata()#讀取數(shù)據(jù) center = init(k) # 獲取初始類(lèi)別中心 while n > 0: cla_arr = divide(center,data)# 將數(shù)據(jù)分到隨機(jī)選取的類(lèi)中心的里 center = new_center(cla_arr)#更新類(lèi)別中心 n -= 1 sse1 = 0 for j in range(k): for i in range(len(cla_arr[j])): # 計(jì)算每個(gè)類(lèi)里的誤差平方 # 計(jì)算每個(gè)類(lèi)里每個(gè)元素與元素中心的誤差平方 dist1 = math.pow(dist(cla_arr[j][i], center[j]), 2) sse1 += dist1 sse1 = sse1 / len(data) index = index_element(cla_arr,data,sw) return center,index,sse1,cla_arr center_l, index,sse1, cla_arr = Kmeans(n,sw) print("類(lèi)別中心為:",center_l) print("所查元素屬于類(lèi)別:",index) print('k值為{0}時(shí)的誤差平方和為{1}'.format(k,sse1))#format格式化占位輸出誤差平方和 def visualization(cla):#聚類(lèi)可視化展現(xiàn) cla_x = [[]] cla_y = [[]] for m in range(k-1):#創(chuàng)建與k值相同維度的空數(shù)組存取x坐標(biāo)和y坐標(biāo) cla_x.append([]) cla_y.append([]) for i in range(k):#遍歷k次讀取k個(gè)類(lèi)別 for j in cla[i]:#遍歷每一類(lèi)存取橫縱坐標(biāo) cla_x[i].append(j[0]) cla_y[i].append(j[1]) plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False plt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei']#解決中文不能顯示的問(wèn)題 plt.figure() plt.xlabel("x") plt.ylabel("y") plt.title("聚類(lèi)圖") plt.scatter(cla_x[0],cla_y[0],c = 'r',marker = 'h') plt.scatter(cla_x[1], cla_y[1], c='y', marker='.') plt.scatter(cla_x[2], cla_y[2], c='g', marker='o') plt.scatter(cla_x[3], cla_y[3], c='b', marker=',') plt.scatter(cla_x[4], cla_y[4], c='k', marker='p') plt.show() visualization(cla_arr) def hand():#畫(huà)出手肘圖 #sse列表是循環(huán)次數(shù)為3,改變k從2到8一個(gè)一個(gè)人工測(cè)得存入 sse = [17.840272113687078,12.116153021227769,8.563862232332205,4.092534331364449,3.573312882789776,3.42794767600246,3.2880646083752185] x = np.linspace(2,8,7)#創(chuàng)建等間距大小為7的數(shù)組 plt.xlabel("k值")#橫坐標(biāo)名稱(chēng) plt.ylabel("誤差平方和")#縱坐標(biāo)名稱(chēng) plt.title("手肘圖")#曲線(xiàn)名 plt.plot(x,sse)#畫(huà)出曲線(xiàn) plt.show() hand()
2.代碼結(jié)果展示:
聚類(lèi)可視化圖:
手肘圖:
運(yùn)行結(jié)果:
文章參考:
手肘法:K-means聚類(lèi)最優(yōu)k值的選取_qq_15738501的博客-CSDN博客_kmeans聚類(lèi)k的選取
matplotpb.pyplot.scatter散點(diǎn)圖的畫(huà)法:
PYthon——plt.scatter各參數(shù)詳解_yuanCruise-CSDN博客_plt.scatter
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