Python實(shí)現(xiàn)npy/mat文件的保存與讀取
除了常用的csv文件和excel文件之外,我們還可以通過PY把數(shù)據(jù)保存文npy文件格式和mat文件格式。
1. npy文件
npy即numpy對(duì)應(yīng)的文件格式,關(guān)于其保存使用的是np.save()方法,其讀取使用的是np.load()方法。
具體示例如下:
import numpy as np a = np.mat('1, 2, 3;4, 5, 6') print(a) print(type(a)) print("=================================") b = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]]) print(b) print(type(b))
保存文件:
如圖,矩陣和numpy數(shù)組都支持以npy文件類型保存。
np.save('a.npy', a) np.save('b.npy', b)??????????????????
讀取文件
data1 = np.load('a.npy') data2 = np.load('b.npy') print(data1) print(type(data1)) print("=================================") print(data2) print(type(data2))
如圖npy數(shù)據(jù)被成功讀取,且都是numpy數(shù)組數(shù)據(jù)類型。
2. mat文件
保存為mat文件依賴于scipy庫中的scipy.io.savemat()方法,讀取則需要用到scipy.io.loadmat()方法。
保存時(shí),不僅僅需要傳入變量,還需要將該變量的類型一并以字典的形式傳入,一樣支持numpy數(shù)組和矩陣。
具體示例如下:
import numpy as np from scipy import io a = np.mat('1, 2, 3;4, 5, 6') print(a) print(type(a)) print("=================================") b = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6]]) print(b) print(type(b)) io.savemat('a.mat', {'matrix': a}) io.savemat('b.mat', {'array': b})
讀取數(shù)據(jù)
data1 = io.loadmat('a.mat') print(data1) print(type(data1)) print("=================================") data2 = io.loadmat('b.mat') print(data2) print(type(data2))
如圖,數(shù)據(jù)成功被讀取。但是讀取的結(jié)果是一個(gè)字典,如果需要進(jìn)一步讀取到數(shù)據(jù),則需要根據(jù)鍵名將其取出:
print(data1['matrix']) print(type(data1['matrix'])) print("=================================") print(data2['array']) print(type(data2['array']))
取出時(shí)的鍵與存儲(chǔ)時(shí)的變量類型有關(guān),取出的數(shù)據(jù)都是numpy數(shù)組,不再有矩陣類型。
補(bǔ)充
讀取mat文件并存為npy格式文件
具體見代碼,注意h5py的轉(zhuǎn)置問題
import numpy as np from scipy import io mat = io.loadmat('yourfile.mat') # 如果報(bào)錯(cuò):Please use HDF reader for matlab v7.3 files # 改為下一種方式讀取 import h5py mat = h5py.File('yourfile.mat') # mat文件里可能有多個(gè)cell,各對(duì)應(yīng)著一個(gè)dataset # 可以用keys方法查看cell的名字, 現(xiàn)在要用list(mat.keys()), # 另外,讀取要用data = mat.get('名字'), 然后可以再用Numpy轉(zhuǎn)為array print(mat.keys()) # 可以用values方法查看各個(gè)cell的信息 print(mat.values()) # 可以用shape查看維度信息 print(mat['your_dataset_name'].shape) # 注意,這里看到的shape信息與你在matlab打開的不同 # 這里的矩陣是matlab打開時(shí)矩陣的轉(zhuǎn)置 # 所以,我們需要將它轉(zhuǎn)置回來 mat_t = np.transpose(mat['your_dataset_name']) # mat_t 是numpy.ndarray格式 # 再將其存為npy格式文件 np.save('yourfile.npy', mat_t)
npy文件的讀取很簡(jiǎn)單
import numpy as np matrix = np.load('yourfile.npy')
重新讀取npy文件保存為mat文件
方法一(在MATLAB雙擊打開時(shí)遇到了錯(cuò)誤:Unable to read MAT-file *********.mat. Not a binary MAT-file. Try load -ASCII to read as text. ):
import numpy as np matrix = np.load('yourfile.npy') f = h5py.File('yourfile.mat', 'w') f.create_dataset('dataname', data=matrix) # 這里不會(huì)將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)置
方法二(使用scipy):
from scipy import io mat = np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy') io.savemat('gene_features.mat', {'gene_features': mat})
到此這篇關(guān)于Python實(shí)現(xiàn)npy/mat文件的保存與讀取的文章就介紹到這了,更多相關(guān)Python npy mat文件保存讀取內(nèi)容請(qǐng)搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章希望大家以后多多支持腳本之家!
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