Python提高運(yùn)行速度工具之Pandarallel的使用教程
眾所周知,由于 GIL 的存在,Python 單進(jìn)程中的所有操作都是在一個(gè)CPU核上進(jìn)行的,所以為了提高運(yùn)行速度,我們一般會(huì)采用多進(jìn)程的方式。而多進(jìn)程無非就是以下幾種方案:
- multiprocessing
- concurrent.futures.ProcessPoolExecutor()
- joblib
- ppserver
- celery
這些方案對(duì)于普通 python 玩家來說都不是特別友好,怎樣才能算作一個(gè)友好的并行處理方案?
那就是原來的邏輯我基本不用變,僅修改需要計(jì)算的那行就能完成我們目標(biāo)的方案,而 pandarallel 就是一個(gè)這樣友好的工具。
可以看到,在 pandarallel 的世界里,你只需要替換原有的 pandas 處理語句就能實(shí)現(xiàn)多CPU并行計(jì)算。非常方便、非常nice.
在4核CPU的性能測(cè)試上,它比原始語句快了接近4倍。測(cè)試條件(OS: Linux Ubuntu 16.04,Hardware: Intel Core i7 @ 3.40 GHz - 4 cores),這就是我所說的,它把CPU充分利用了起來。
下面就給大家介紹這個(gè)模塊怎么用,其實(shí)非常簡(jiǎn)單,任何代碼只需要加幾行代碼就能實(shí)現(xiàn)質(zhì)的飛躍。
1.準(zhǔn)備
開始之前,你要確保Python和pip已經(jīng)成功安裝在電腦上
pip install pandarallel
2.使用 Pandarallel
使用前,需要對(duì)Pandarallel進(jìn)行初始化:
from pandarallel import pandarallel pandarallel.initialize()
這樣才能調(diào)用并行計(jì)算的API,不過 initialize 中有一個(gè)重要參數(shù)需要說明,那就是 nb_workers ,它將指定并行計(jì)算的Worker數(shù),如果沒有設(shè)置,所有CPU的核都會(huì)用上。
Pandarallel一共支持8種Pandas操作,下面是一個(gè)apply方法的例子。
import pandas as pd import time import math import numpy as np from pandarallel import pandarallel # 初始化 pandarallel.initialize() df_size = int(5e6) df = pd.DataFrame(dict(a=np.random.randint(1, 8, df_size), b=np.random.rand(df_size))) def func(x): return math.sin(x.a**2) + math.sin(x.b**2) # 正常處理 res = df.apply(func, axis=1) # 并行處理 res_parallel = df.parallel_apply(func, axis=1) # 查看結(jié)果是否相同 res.equals(res_parallel)
其他方法使用上也是類似的,在原始的函數(shù)名稱前加上 parallel_,比如 DataFrame.groupby.apply:
import pandas as pd import time import math import numpy as np from pandarallel import pandarallel # 初始化 pandarallel.initialize() df_size = int(3e7) df = pd.DataFrame(dict(a=np.random.randint(1, 1000, df_size), b=np.random.rand(df_size))) def func(df): dum = 0 for item in df.b: dum += math.log10(math.sqrt(math.exp(item**2))) return dum / len(df.b) # 正常處理 res = df.groupby("a").apply(func) # 并行處理 res_parallel = df.groupby("a").parallel_apply(func) res.equals(res_parallel)
又比如 DataFrame.groupby.rolling.apply:
import pandas as pd import time import math import numpy as np from pandarallel import pandarallel # 初始化 pandarallel.initialize() df_size = int(1e6) df = pd.DataFrame(dict(a=np.random.randint(1, 300, df_size), b=np.random.rand(df_size))) def func(x): return x.iloc[0] + x.iloc[1] ** 2 + x.iloc[2] ** 3 + x.iloc[3] ** 4 # 正常處理 res = df.groupby('a').b.rolling(4).apply(func, raw=False) # 并行處理 res_parallel = df.groupby('a').b.rolling(4).parallel_apply(func, raw=False) res.equals(res_parallel)
案例都是類似的,這里就直接列出表格,不浪費(fèi)大家寶貴的時(shí)間去閱讀一些重復(fù)的例子了:
3.注意事項(xiàng)
1. 我有 8 個(gè) CPU,但 parallel_apply 只能加快大約4倍的計(jì)算速度。為什么?
答:正如我前面所言,Python中每個(gè)進(jìn)程占用一個(gè)核,Pandarallel 最多只能加快到你所擁有的核心的總數(shù),一個(gè) 4 核的超線程 CPU 將向操作系統(tǒng)顯示 8 個(gè) CPU,但實(shí)際上只有 4 個(gè)核心,因此最多加快4倍。
2. 并行化是有成本的(實(shí)例化新進(jìn)程,通過共享內(nèi)存發(fā)送數(shù)據(jù),…),所以只有當(dāng)并行化的計(jì)算量足夠大時(shí),并行化才是有意義的。對(duì)于很少量的數(shù)據(jù),使用 Pandarallel 并不總是值得的。
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