Python可視化繪制圖表的教程詳解
python 有許多可視化工具,但本書只介紹Matplotlib。Matplotlib是一種2D的繪圖庫,它可以支持硬拷貝和跨系統(tǒng)的交互,它可以在python腳本,IPython的交互環(huán)境下、Web應(yīng)用程序中使用。該項目是由John Hunter 于2002年啟動,其目的是為python構(gòu)建MATLAB式的繪圖接口。如果結(jié)合使用一種GUI工具包(如IPython),Matplotlib還具有諸如縮放和平移等交互功能。它不僅支持各種操作系統(tǒng)上許多不同的GUI后端,而且還能將圖片導(dǎo)出為各種常見的矢量(vector)和光柵(raster)圖:PDF、SVG、JPG、PNG、BMP、GIF等。
1.Matplotlib 程序包
所謂“一圖勝千言”,我們很多時候需要通過可視化的方式查看、分析數(shù)據(jù),雖然pandas中也有一些繪圖操作,但是相比較而言,Matplotlib在繪圖顯示效果方面更加絢麗。Pyplot為Matplotlib提供了一個方便的接口,我們可以通過pyplot對matplotlib進(jìn)行操作,多數(shù)情況下pyplot的命令與MATLAB有些相似。
導(dǎo)入Matplotlib包進(jìn)行簡單的操作(此處需要安裝pip install matplotlib):
import matplotlib.pyplot as plt #首先定義兩個函數(shù)(正弦&余弦) import numpy as np X = np.linspace(-np.pi,np.pi,256,endpoint=True) #-Π to +Π的256個值 C,S = np.cos(X),np.sin(X) plt.plot(X,C) plt.plot(X,S) #在ipython 的交互環(huán)境中需要這句才能顯示出來 plt.show()
2.繪圖命令的基本架構(gòu)及其屬性設(shè)置
上面的例子我們可以看出,幾乎所有的屬性和繪圖的框架我們都選用默認(rèn)設(shè)置?,F(xiàn)在我們來看Pyplot 繪圖的基本框架是什么,用過photoshop的人都知道,作圖時先要定義一個畫布,此處的畫布就是Figure,然后把其他素材“畫”到該Figure上。
(1)在Figure 上創(chuàng)建子plot,并設(shè)置屬性,
具體簡析和代碼如下:
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x = np.linspace(0,10,1000) #X軸數(shù)據(jù) y1 = np.sin(x) #Y軸數(shù)據(jù) y2 = np.cos(x**2) #Y軸數(shù)據(jù) plt.figure(figsize=(8,4)) plt.plot(x,y1,label="$sin(x)$",color="red",linewidth=2) plt.plot(x,y2,"b--",label="$cos(x^2)$") #指定曲線的顏色和線形,如“b--”表示藍(lán)色虛線(b:藍(lán)色,-:虛線) plt.xlabel("Time(s)") plt.ylabel("Volt") plt.title("PyPlot First Example") #書上寫的是:plt.figure(figsize(8,4)) #注意:會報錯 name 'figsize' is not defined #這里figsize是一個參數(shù),并不是一個函數(shù),給參數(shù)賦值中間需要加一個等號,寫為:plt.figure(figsize=(8,4)) #使用關(guān)鍵字參數(shù)可以指定所繪制的曲線的各種屬性: #label:給曲線指定一個標(biāo)簽名稱,此標(biāo)簽將在圖示中顯示。如果標(biāo)簽字符串的前后有字符“$”,則Matplotlib 會使用其內(nèi)嵌的LaTex引擎將其顯示為數(shù)學(xué)公式 #color:指定曲線的顏色。顏色可以用如下方法表示 #英文單詞 #以“#”字符開頭的3個16進(jìn)制數(shù),如“#ff0000”表示紅色。以0~1的RGB表示,如(1.0,0.0,0.0)也表示紅色 #linewidth:指定曲線的寬度,可以不是整數(shù),也可以使用縮寫形式的參數(shù)名lw plt.ylim(-1.5,1.5) plt.legend() plt.show()
(2)在Figure上創(chuàng)建多個子plot
如果需要同時繪制多幅圖表的話,可以給Figure傳遞一個整數(shù)參數(shù)指定圖表的序號,如果所指定序號的繪圖對象已經(jīng)存在的話,將不創(chuàng)建新的對象,而只是讓它成為當(dāng)前繪圖對象,具體分析和代碼如下:
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt fig1 =plt.figure(2) plt.subplot(211) #subplot(211)把繪圖區(qū)域等分為2行*1列共兩個區(qū)域 #然后在區(qū)域1(上區(qū)域)中創(chuàng)建一個軸對象 plt.subplot(212)#在區(qū)域2(下區(qū)域)創(chuàng)建一個軸對象 plt.show()
#我們還可通過命令再次拆分這些塊(相當(dāng)于Word中拆分單元格的操作) f1 = plt.figure(5) plt.subplot(221) plt.subplot(222) plt.subplot(212) plt.subplots_adjust(left = 0.08,right = 0.95,wspace = 0.25,hspace = 0.45) #subplots_adjust的操作是類似網(wǎng)頁csv格式化中的邊距處理,左邊距離多少? #右邊邊距多少?這個取決于你需要繪制的大小和各個模塊之間的間距。 plt.show()
(3)通過Axes設(shè)置當(dāng)前對象plot的屬性
以上我們操作的是在Figure上繪制圖案,但是當(dāng)我們繪制的圖案過多,又需要選取不同的小模塊進(jìn)行格式化設(shè)置時,Axes對象就能很好的解決這個問題。具體簡析和代碼如下:
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt fig,axes = plt.subplots(nrows=2,ncols=2) #定一個2*2的plot plt.show()
#現(xiàn)在我們需要通過命令來操作每個plot(subplot),設(shè)置他們的title并刪除橫縱坐標(biāo)值 fig,axes =plt.subplots(nrows=2,ncols=2) axes[0,0].set(title="Upper Left") axes[0,1].set(title="Upper Right") axes[1,0].set(title="Lower Left") axes[1,1].set(title="Lower Right")
另外,實際來說,plot操作的底層操作就是Axes對象的操作,只不過如果我們不使用Axes而用plot操作時,它默認(rèn)的是plot.subplot(111),也就是說plot其實是Axes的特例
(4)保存Figure對象
最后一項操作就是保存,我們繪制的目的是用在其他研究中,或者希望可以把研究結(jié)果保存下來,此時需要的操作是save。具體簡析和代碼如下:
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt plt.savefig("save_test.png",dpi=520) #默認(rèn)像素是dpi是80 #此處只是用了savefig屬性對Figure進(jìn)行保存
另外,除了上述的基本操作之外,Matplotlib還有其他的繪圖優(yōu)勢,此處只是簡單介紹了它在繪圖時需要注意的事項。
3.Seaborn 模塊介紹
前面我們簡單介紹了Matplotlib庫的繪圖功能和屬性設(shè)置,對于常規(guī)性的繪圖,使用pandas的API屬性研究較為透徹,幾乎沒有不能解決的問題。但是有的時候Matplotlib還是有它的不足之處,Matplotlib 自動化程度非常高,但是,掌握如何設(shè)置系統(tǒng)以便獲得一個吸引人的圖是相當(dāng)困難的事。為了控制Matplotlib圖表的外觀,Seaborn 模塊自帶許多定制的主題和高級的接口。
3.1 未加Seaborn 模塊的效果
具體簡析和代碼如下:
#有關(guān)于seaborn介紹 import numpy as np import matplotlib as mpl import matplotlib.pyplot as plt np.random.seed(sum(map(ord,"aesthetics"))) #首先定義一個函數(shù)用來畫正弦函數(shù),可幫助了解可以控制的不同風(fēng)格參數(shù) def sinplot(flip=1): x=np.linspace(0,14,100) for i in range(1,7): plt.plot(x,np.sin(x+i*.5)*(7-i)*flip) sinplot() plt.show()
#有關(guān)于seaborn介紹 import numpy as np import matplotlib as mpl import matplotlib.pyplot as plt np.random.seed(sum(map(ord,"aesthetics"))) def sinplot(flip=1): x = np.linspace(0,14,100) for i in range(1,7): plt.plot(x,np.sin(x + i * .5) * (7-i) * flip) #轉(zhuǎn)換成Seaborn 模塊,只需要引入seaborn模塊 import seaborn as sns #不同之處在此 sinplot() plt.show()
使用seaborn的優(yōu)點有:1.seaborn默認(rèn)淺灰色背景與白色網(wǎng)格線的靈感來源于Matplotlib,卻比matplotlib的顏色更加柔和;2.seaborn把繪圖風(fēng)格參數(shù)與數(shù)據(jù)參數(shù)分開設(shè)置。seaborn有兩組函數(shù)對風(fēng)格進(jìn)行控制:axes_style()/set_style()函數(shù)和plotting_context()/set_context()函數(shù)。axes_style()函數(shù)和plotting_context()函數(shù)返回參數(shù)字典,set_style()函數(shù)和set_context()函數(shù)設(shè)置Matplotlib。
(1)使用set_style()函數(shù)
具體通過cording查看效果:
import seaborn as sns sns.set_style("ticks") sns.set_style("whitegrid") sinplot() plt.show() #seaborn 有5種預(yù)定義的主題: #darkgrid (灰色背景+白網(wǎng)格) #whitegrid(白色背景+黑網(wǎng)格) #dark (僅灰色背景) #white (僅白色背景) #ticks (坐標(biāo)軸帶刻度) #默認(rèn)的主題是darkgrid,修改主題可以使用set_style()函數(shù)
(2)使用set_context()函數(shù)
具體通過coding查看效果:
import seaborn as sns sns.set_context("paper") sinplot() plt.show() #上下文(context)可以設(shè)置輸出圖片的大小尺寸(scale) #seaborn中預(yù)定義的上下文有4種:paper、notebook、talk和poster。 默認(rèn)使用notebook上下文
(3)使用Seaborn“耍酷”
然而seaborn 不僅能夠用來更改背景顏色,或者改變畫布大小,還有其他很多方面的用途,比如下面這個例子:
import seaborn as sns sns.set() #通過加載sns自帶數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)(具體數(shù)據(jù)可以不關(guān)心) flights_long = sns.load_dataset("flights") flights = flights_long.pivot("month","year","passengers") #使用每個單元格中的數(shù)據(jù)值繪制一個熱圖heatmap sns.heatmap(flights,annot=True,fmt="d",linewidths=.5) plt.show()
4.描述性統(tǒng)計圖形概覽
描述性統(tǒng)計是借助圖表或者總結(jié)性的數(shù)值來描述數(shù)據(jù)的統(tǒng)計手段。數(shù)據(jù)挖掘工作的數(shù)據(jù)分析階段,我們可借助描述性統(tǒng)計來描述或總結(jié)數(shù)據(jù)的基本情況,一來可以梳理自己的思維,二來可以更好地向他人展示數(shù)據(jù)分析結(jié)果。數(shù)值分析的過程中,我們往往要計算出數(shù)據(jù)的統(tǒng)計特征,用來做科學(xué)計算的Numpy和SciPy工具可以滿足我們的需求。Matplotlib工具可用來繪制圖,滿足圖分析的需求。
4.1制作數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)是自己制作的,主要包括個人身高、體重及一年的借閱圖書量(之所以自己制作數(shù)據(jù)是因為不是每份真實的數(shù)據(jù)都可以進(jìn)行接下來的分析,比如有些數(shù)據(jù)就不能繪制餅圖,另一個角度也說明,此處舉例的數(shù)據(jù)其實沒有實際意義,只是為了分析而舉例,但是不代表在具體的應(yīng)用中這些分析不能發(fā)揮作用)。
另外,以下的數(shù)據(jù)顯示都是在Seaborn庫的作用下體現(xiàn)的效果。
#案例分析(結(jié)合圖書情報學(xué),比如借書量) from numpy import array from numpy.random import normal def getData(): heights = [] weights = [] books = [] N =10000 for i in range(N): while True: #身高服從均值為172,標(biāo)準(zhǔn)差為6的正態(tài)分布 height = normal(172,6) if 0<height:break while True: #體重由身高作為自變量的線性回歸模型產(chǎn)生,誤差服從標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布 weight = (height-80)*0.7 + normal(0,1) if 0 < weight:break while True: #借閱量服從均值為20,標(biāo)準(zhǔn)差為5的正態(tài)分布 number = normal(20,5) if 0<= number and number<=50: book = "E"if number <10 else("D"if number<15 else ("C"if number<20 else("B"if number<25 else "A"))) break heights.append(height) weights.append(weight) books.append(book) return array(heights),array(weights),array(books) heights,weights,books =getData()
4.2 頻數(shù)分析
(1)定性分析
柱狀圖和餅形圖是對定性數(shù)據(jù)進(jìn)行頻數(shù)分析的常用工具,使用前需將每一類的頻數(shù)計算出來。
①柱狀圖。柱狀圖是以柱的高度來指代某種類型的頻數(shù),使用Matplotlib對圖書借閱量這一定性變量繪制柱狀圖的代碼如下:
from matplotlib import pyplot #繪制柱狀圖 def drawBar(books): xticks=["A","B","C","D","E"] bookGroup ={ } #對每一類借閱量進(jìn)行頻數(shù)統(tǒng)計 for book in books: bookGroup[book] = bookGroup.get(book,0) + 1 #創(chuàng)建柱狀圖 #第一個參數(shù)為柱的橫坐標(biāo) #第二個參數(shù)為柱的高度 #參數(shù)align為柱的對齊方式,以第一個參數(shù)為參考標(biāo)準(zhǔn) pyplot.bar(range(5),[bookGroup.get(xtick,0) for xtick in xticks],align="center") #設(shè)置柱的文字說明 #第一個參數(shù)為文字說明的橫坐標(biāo) #第二個參數(shù)為文字說明的內(nèi)容 pyplot.xticks(range(5),xticks) #設(shè)置橫坐標(biāo)的文字說明 pyplot.xlabel("Types of Students") #設(shè)置縱坐標(biāo)的文字說明 pyplot.ylabel("Frequency") #設(shè)置標(biāo)題 pyplot.title("Numbers of Books Students Read") #繪圖 pyplot.show() drawBar(books)
import matplotlib.pyplot as plt num_list = [1506,3500,3467,1366,200] pyplot.xlabel("Types of Students") pyplot.ylabel("Frequency") pyplot.title("Numbers of Books Students Read") plt.bar(range(len(num_list)), num_list,color="green") import seaborn as sns sns.set_style("whitegrid") plt.show()
②餅形圖。餅形圖是以扇形的面積來指代某種類型的頻率,使用Matplotlib對圖書借閱量這一定性變量繪制餅形圖的代碼如下:
import numpy as np import matplotlib.mlab as mlab import matplotlib.pyplot as plt labels=['A','B','C','D','E'] X=[257,145,32,134,252] fig = plt.figure() plt.pie(X,labels=labels,autopct='%1.1f%%') #畫餅圖(數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)對應(yīng)的標(biāo)簽,百分?jǐn)?shù)保留兩位小數(shù)點) plt.title("Numbers of Books Student Read") plt.show()
(2)定量分析
直方圖類似于柱狀圖,是用柱的高度來指代頻數(shù),不同的是其將定量數(shù)據(jù)劃分為若干連續(xù)的區(qū)間,在這些連續(xù)的區(qū)間上繪制柱。
①直方圖。使用Matplotlib對身高這一定量變量繪制直方圖的代碼如下:
#繪制直方圖 def drawHist(heights): #創(chuàng)建直方圖 #第一個參數(shù)為待繪制的定量數(shù)據(jù),不同于定性數(shù)據(jù),這里并沒有實現(xiàn)進(jìn)行頻數(shù)統(tǒng)計 #第二個參數(shù)為劃分的區(qū)間個數(shù) pyplot.hist(heights,100) pyplot.xlabel('Heights') pyplot.ylabel('Frequency') pyplot.title('Height of Students') pyplot.show() drawHist(heights)
累積曲線:使用Matplotlib對身高這一定量變量繪制累積曲線的代碼如下:
#繪制累積曲線 def drawCumulativaHist(heights): #創(chuàng)建累積曲線 #第一個參數(shù)為待繪制的定量數(shù)據(jù) #第二個參數(shù)為劃分的區(qū)間個數(shù) #normal參數(shù)為是否無量綱化 #histtype參數(shù)為‘step',繪制階梯狀的曲線 #cumulative參數(shù)為是否累積 pyplot.hist(heights,20,normed=True,histtype='step',cumulative=True) pyplot.xlabel('Heights') pyplot.ylabel('Frequency') pyplot.title('Heights of Students') pyplot.show() drawCumulativaHist(heights)
(3)關(guān)系分析
散點圖。在散點圖中,分別以自變量和因變量作為橫坐標(biāo)。當(dāng)自變量與因變量線性相關(guān)時,散點圖中的點近似分布在一條直線上。我們以身高作為自變量,體重作為因變量,討論身高對體重的影響。使用Matplotlib繪制散點圖的代碼如下:
#繪制散點圖 def drawScatter(heights,weights): #創(chuàng)建散點圖 #第一個參數(shù)為點的橫坐標(biāo) #第二個參數(shù)為點的縱坐標(biāo) pyplot.scatter(heights,weights) pyplot.xlabel('Heights') pyplot.ylabel('Weight') pyplot.title('Heights & Weight of Students') pyplot.show() drawScatter(heights,weights)
(4)探索分析
箱型圖。在不明確數(shù)據(jù)分析的目標(biāo)時,我們對數(shù)據(jù)進(jìn)行一些探索性的分析,可以知道數(shù)據(jù)的中心位置、發(fā)散程度及偏差程度。使用Matplotlib繪制關(guān)于身高的箱型圖代碼如下:
#繪制箱型圖 def drawBox(heights): #創(chuàng)建箱型圖 #第一個參數(shù)為待繪制的定量數(shù)據(jù) #第二個參數(shù)為數(shù)據(jù)的文字說明 pyplot.boxplot([heights],labels=['Heights']) pyplot.title('Heights of Students') pyplot.show() drawBox(heights)
注:
① 上四分位數(shù)與下四分位數(shù)的差叫四分位差,它是衡量數(shù)據(jù)發(fā)散程度的指標(biāo)之一
② 上界線和下界線是距離中位數(shù)1.5倍四分位差的線,高于上界線或者低于下界線的數(shù)據(jù)為異常值
描述性統(tǒng)計是容易操作、直觀簡潔的數(shù)據(jù)分析手段。但是由于簡單,對于多元變量的關(guān)系難以描述?,F(xiàn)實生活中,自變量通常是多元的:決定體重的不僅有身高,還有飲食習(xí)慣、肥胖基因等因素。通過一些高級的數(shù)據(jù)處理手段,我們可以對多元變量進(jìn)行處理,例如,特征工程中,可以使用互信息方法來選擇多個對因變量有較強(qiáng)相關(guān)性的自變量作為特征,還可以使用主成分分析法來消除一些冗余的自變量來降低運算復(fù)雜度。
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