python如何批量讀取.mat文件并保存成.npy
python批量讀取.mat文件并保存成.npy
import numpy as np from scipy import io import os file_path = 'dataset/noise_FM' # 批量處理mat數(shù)據(jù),reshape為1000 x 1024,并存為.npy def reshape_file(file_path): files = os.listdir(file_path) for file_origin in files: file = os.path.join(file_path, file_origin) data_mat = io.loadmat(file) data = data_mat['shiyu_pro'] #注意,通過(guò)io.loadmat加載的數(shù)據(jù)為字典格式 data.reshape(1000, 1024) file_name = file_origin.split('.')[0] save_path = 'redata/noise_FM/' + file_name np.save(save_path, data) # 批量加載.npy def loadnpy(file_path): files = os.listdir(file_path) A[] = np.load(files) for file_origin in files: file = os.path.join(file_path, file_origin) data = np.load(file) A.append(data)
python讀取.mat文件時(shí)出現(xiàn)錯(cuò)誤解決
NotImplementedError: Please use HDF reader for matlab v7.3 files
#最初用loadmat讀取數(shù)據(jù)
import numpy as np from scipy import io mat = io.loadmat('test.mat')
#如果報(bào)錯(cuò):NotImplementedError:Please use HDF reader for matlab v7.3 files
更改為h5py方式讀取
import h5py mat = h5py.File('test.mat')
mat文件里可能有多個(gè)cell,各對(duì)應(yīng)著一個(gè)dataset
可以用keys方法查看cell的名字
print(mat.keys())
可以用values方法查看各個(gè)cell的信息
print(mat.values())
可以用shape查看維度信息
print(mat['your_dataset_name'].shape)
注意,這里看到的shape信息與你在matlab打開(kāi)的不同
這里的矩陣是matlab打開(kāi)時(shí)矩陣的轉(zhuǎn)置
所以,我們需要將它轉(zhuǎn)置回來(lái)
mat_t = np.transpose(mat['your_dataset_name']) mat_t 是numpy.ndarray格式
再將其存為npy格式文件
np.save('test.npy', mat_t)
npy文件的讀取很簡(jiǎn)單
import numpy as np matrix = np.load('yourfile.npy')
可以重新讀取npy文件保存為mat文件
方法一(在MATLAB雙擊打開(kāi)時(shí)遇到了錯(cuò)誤:Unable to read MAT-file *.mat. Not a binary MAT-file. Try load -ASCII to read as text. ):
import numpy as np matrix = np.load('yourfile.npy') f = h5py.File('yourfile.mat', 'w') f.create_dataset('dataname', data=matrix)
這里不會(huì)將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)置
方法二(使用scipy):
from scipy import io mat = np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy') io.savemat('gene_features.mat', {'gene_features': mat})
總結(jié)
以上為個(gè)人經(jīng)驗(yàn),希望能給大家一個(gè)參考,也希望大家多多支持腳本之家。
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