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python如何批量讀取.mat文件并保存成.npy

 更新時間:2022年12月14日 09:57:35   作者:HopeTiger_only1  
這篇文章主要介紹了python如何批量讀取.mat文件并保存成.npy問題,具有很好的參考價值,希望對大家有所幫助。如有錯誤或未考慮完全的地方,望不吝賜教

python批量讀取.mat文件并保存成.npy

import numpy as np
from scipy import io
import os

file_path = 'dataset/noise_FM'

# 批量處理mat數(shù)據(jù),reshape為1000 x 1024,并存為.npy
def reshape_file(file_path):
    files = os.listdir(file_path)
    for file_origin in files:
        file = os.path.join(file_path, file_origin)
        data_mat = io.loadmat(file)
        data = data_mat['shiyu_pro'] #注意,通過io.loadmat加載的數(shù)據(jù)為字典格式
        data.reshape(1000, 1024)
        file_name = file_origin.split('.')[0]
        save_path = 'redata/noise_FM/' + file_name
        np.save(save_path, data)

# 批量加載.npy
def loadnpy(file_path):
    files = os.listdir(file_path)
    A[] = np.load(files)
    for file_origin in files:
        file = os.path.join(file_path, file_origin)
        data = np.load(file)
        A.append(data)

python讀取.mat文件時出現(xiàn)錯誤解決

NotImplementedError: Please use HDF reader for matlab v7.3 files

#最初用loadmat讀取數(shù)據(jù)

import numpy as np
from scipy import io
mat = io.loadmat('test.mat')

#如果報錯:NotImplementedError:Please use HDF reader for matlab v7.3 files

更改為h5py方式讀取

import h5py
mat = h5py.File('test.mat')

mat文件里可能有多個cell,各對應著一個dataset

可以用keys方法查看cell的名字

print(mat.keys())

可以用values方法查看各個cell的信息

print(mat.values())

可以用shape查看維度信息

print(mat['your_dataset_name'].shape)

注意,這里看到的shape信息與你在matlab打開的不同

這里的矩陣是matlab打開時矩陣的轉置

所以,我們需要將它轉置回來

mat_t = np.transpose(mat['your_dataset_name'])
mat_t 是numpy.ndarray格式

再將其存為npy格式文件

np.save('test.npy', mat_t)

npy文件的讀取很簡單

import numpy as np
matrix = np.load('yourfile.npy')

可以重新讀取npy文件保存為mat文件

方法一(在MATLAB雙擊打開時遇到了錯誤:Unable to read MAT-file *.mat. Not a binary MAT-file. Try load -ASCII to read as text. ):

import numpy as np
matrix = np.load('yourfile.npy')
f = h5py.File('yourfile.mat', 'w')
f.create_dataset('dataname', data=matrix)

這里不會將數(shù)據(jù)轉置

方法二(使用scipy):

from scipy import io
mat = np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy')
io.savemat('gene_features.mat', {'gene_features': mat})

總結

以上為個人經(jīng)驗,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。

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