技術(shù)背景

GPU的加速技術(shù)在深度學(xué)習(xí)、量子計(jì)算領(lǐng)域都已經(jīng)被廣泛的應(yīng)用。其適用的計(jì)算模型是小內(nèi)存的密集型計(jì)算場(chǎng)景，如果計(jì)算的模型內(nèi)存較大，則需要使用到共享內(nèi)存，這會(huì)直接導(dǎo)致巨大的數(shù)據(jù)交互的運(yùn)算量，通信開(kāi)銷較大。因?yàn)閜ycuda的出現(xiàn)，也使得我們可以直接在python內(nèi)直接使用GPU函數(shù)，當(dāng)然也可以直接在python代碼中集成一些C++的代碼，用于構(gòu)建GPU計(jì)算的函數(shù)。有一個(gè)專門(mén)介紹pycuda使用案例的中文開(kāi)源代碼倉(cāng)可以簡(jiǎn)單參考一些實(shí)現(xiàn)的示例，但是這里面的示例數(shù)量還是比較有限，更多的案例可以直接參考pycuda官方文檔。

pycuda環(huán)境配置

pycuda的安裝環(huán)境很大程度上取決約顯卡驅(qū)動(dòng)本身是否能夠安裝成功，除了安裝pycuda庫(kù)本身之外，重點(diǎn)是需要確保如下的指令可以運(yùn)行成功：

[dechin@dechin-manjaro pycuda]$ nvidia-smi
Sun Mar 21 20:26:43 2021       
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 455.45.01    Driver Version: 455.45.01    CUDA Version: 11.1     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                               |                      |               MIG M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  GeForce MX250       Off  | 00000000:3C:00.0 Off |                  N/A |
| N/A   48C    P0    N/A /  N/A |      0MiB /  2002MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
                                                                               
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                  |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                  GPU Memory |
|        ID   ID                                                   Usage      |
|=============================================================================|
|  No running processes found                                                 |
+-----------------------------------------------------------------------------+

上述返回的結(jié)果是一個(gè)沒(méi)有GPU任務(wù)情況下的展示界面，包含有顯卡型號(hào)、顯卡內(nèi)存等信息。如果存在執(zhí)行的任務(wù)，則顯示結(jié)果如下案例所示：

[dechin@dechin-manjaro pycuda]$ nvidia-smi
Sun Mar 21 20:56:04 2021       
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 455.45.01    Driver Version: 455.45.01    CUDA Version: 11.1     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                               |                      |               MIG M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  GeForce MX250       Off  | 00000000:3C:00.0 Off |                  N/A |
| N/A   47C    P0    N/A /  N/A |     31MiB /  2002MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
                                                                               
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                  |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                  GPU Memory |
|        ID   ID                                                   Usage      |
|=============================================================================|
|    0   N/A  N/A     18427      C   python3                            29MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

我們發(fā)現(xiàn)這里多了一個(gè)pid為18427的python的進(jìn)程正在使用GPU進(jìn)行計(jì)算。在運(yùn)算過(guò)程中，如果任務(wù)未能夠執(zhí)行成功，有可能在內(nèi)存中遺留一個(gè)進(jìn)程，這需要我們自己手動(dòng)去釋放。最簡(jiǎn)單粗暴的方法就是：直接使用kill -9 pid來(lái)殺死殘留的進(jìn)程。我們可以使用pycuda自帶的函數(shù)接口，也可以自己寫(xiě)C++代碼來(lái)實(shí)現(xiàn)GPU計(jì)算的相關(guān)功能，當(dāng)然一般情況下更加推薦使用pycuda自帶的函數(shù)。以下為一部分已經(jīng)實(shí)現(xiàn)的接口函數(shù)，比如gpuarray的函數(shù)：

再比如cumath的函數(shù)：

使用GPU計(jì)算向量指數(shù)

對(duì)于一個(gè)向量的指數(shù)而言，其實(shí)就是將每一個(gè)的向量元素取指數(shù)。當(dāng)然，這與前面一篇關(guān)于量子門(mén)操作的博客中介紹的矩陣指數(shù)略有區(qū)別，這點(diǎn)要注意區(qū)分。

在下面的示例中，我們對(duì)比了numpy中實(shí)現(xiàn)的指數(shù)運(yùn)算和pycuda中實(shí)現(xiàn)的指數(shù)運(yùn)算。

# array_exp.py
 
import pycuda.autoinit
import pycuda.gpuarray as ga
import pycuda.cumath as gm
import numpy as np
import sys
 
if sys.argv[1] == '-l':
    length = int(sys.argv[2]) # 從命令行獲取參數(shù)值
 
np.random.seed(1)
array = np.random.randn(length).astype(np.float32)
array_gpu = ga.to_gpu(array)
 
exp_array = np.exp(array)
print (exp_array)
exp_array_gpu = gm.exp(array_gpu)
gpu_exp_array = exp_array_gpu.get()
print (gpu_exp_array)

這里面我們計(jì)算一個(gè)隨機(jī)向量的指數(shù)，向量的維度length是從命令行獲取的一個(gè)參數(shù)，上述代碼的執(zhí)行方式和執(zhí)行結(jié)果如下所示：

[dechin@dechin-manjaro pycuda]$ python3 array_exp.py -l 5
[5.0750957  0.5423974  0.58968204 0.34199178 2.3759744 ]
[5.075096   0.5423974  0.58968204 0.34199178 2.3759747 ]

我們先確保兩者計(jì)算出來(lái)的結(jié)果是一致的，這里我們可以觀察到，兩個(gè)計(jì)算的結(jié)果只保障了7位的有效數(shù)字是相等的，這一點(diǎn)在大部分的場(chǎng)景下精度都是有保障的。接下來(lái)我們使用timeit來(lái)統(tǒng)計(jì)和對(duì)比兩者的性能：

# array_exp.py
 
import pycuda.autoinit
import pycuda.gpuarray as ga
import pycuda.cumath as gm
import numpy as np
import sys
import timeit
 
if sys.argv[1] == '-l':
    length = int(sys.argv[2])
 
np.random.seed(1)
array = np.random.randn(length).astype(np.float32)
array_gpu = ga.to_gpu(array)
 
def npexp():
    exp_array = np.exp(array)
 
def gmexp():
    exp_array_gpu = gm.exp(array_gpu)
    # gpu_exp_array = exp_array_gpu.get()
 
if __name__ == '__main__':
    n = 1000
    t1 = timeit.timeit('npexp()', setup='from __main__ import npexp', number=n)
    print (t1)
    t2 = timeit.timeit('gmexp()', setup='from __main__ import gmexp', number=n)
    print (t2)

這里也順便介紹一下timeit的使用方法：這個(gè)函數(shù)的輸入分別是：函數(shù)名、函數(shù)的導(dǎo)入方式、函數(shù)的重復(fù)次數(shù)。這里需要特別說(shuō)明的是，如果在函數(shù)的導(dǎo)入方式中，不使用__main__函數(shù)進(jìn)行導(dǎo)入，即使是本文件下的python函數(shù)，也是無(wú)法被導(dǎo)入成功的。在輸入的向量達(dá)到一定的規(guī)模大小時(shí)，我們發(fā)現(xiàn)在執(zhí)行時(shí)間上相比于numpy有非常大的優(yōu)勢(shì)。當(dāng)然還有一點(diǎn)需要注意的是，由于我們測(cè)試的是計(jì)算速度，原本使用了get()函數(shù)將GPU中計(jì)算的結(jié)果進(jìn)行導(dǎo)出，但是這部分其實(shí)不應(yīng)該包含在計(jì)算的時(shí)間內(nèi)，因此后來(lái)又注釋掉了。具體的測(cè)試數(shù)據(jù)如下所示：

[dechin@dechin-manjaro pycuda]$ python3 array_exp.py -l 10000000
26.13127974300005
3.469969915000547

總結(jié)概要

使用GPU來(lái)進(jìn)行計(jì)算，可以極大程度上的加速我們所需要計(jì)算的任務(wù)，這得益于GPU強(qiáng)大的自帶的并行化技術(shù)。pycuda的出現(xiàn)，使得我們不需要手工去寫(xiě)GPU的C或者C++代碼也可以調(diào)用GPU來(lái)進(jìn)行計(jì)算，還提供了眾多的python接口可以直接使用。經(jīng)過(guò)測(cè)試，本文給出了一些pycuda的基本使用方法示例，以及初步的測(cè)試結(jié)果，從測(cè)試結(jié)果中我們進(jìn)一步明確了pycuda的高性能特性。

到此這篇關(guān)于Python3+pycuda實(shí)現(xiàn)執(zhí)行簡(jiǎn)單GPU計(jì)算任務(wù)的文章就介紹到這了,更多相關(guān)Python pycuda計(jì)算GPU內(nèi)容請(qǐng)搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章希望大家以后多多支持腳本之家！

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