快捷導(dǎo)航

Pytorch+PyG實現(xiàn)GIN過程示例詳解

更新時間：2023年04月21日 09:57:03 作者：實力

這篇文章主要為大家介紹了Pytorch+PyG實現(xiàn)GIN過程示例詳解，有需要的朋友可以借鑒參考下，希望能夠有所幫助，祝大家多多進步，早日升職加薪

GIN簡介

GIN（Graph Isomorphism Network）是一類基于圖同構(gòu)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。在傳統(tǒng)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中，每個節(jié)點的特征只依賴于其自身特征，但在圖數(shù)據(jù)中，節(jié)點的特征還與其鄰居節(jié)點有關(guān)系。GIN網(wǎng)絡(luò)通過定義可重復(fù)均值池化運算來學(xué)習(xí)節(jié)點及其鄰居的特征表示，并使用多層感知器（MLP）作為逐層轉(zhuǎn)換函數(shù)進行特征提取。

實現(xiàn)步驟

數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

這里我們?nèi)匀贿x用Cora數(shù)據(jù)集作為示例數(shù)據(jù)。由于GIN采用基于點、簡單且無參數(shù)的鄰域聚合方式，因此不需要額外對數(shù)據(jù)做處理，直接使用即可。

import torch.nn.functional as F
from torch_geometric.datasets import Planetoid
from torch_geometric.utils import from_networkx, to_networkx
# 加載Cora數(shù)據(jù)集
dataset = Planetoid(root='./cora', name='Cora')
data = dataset[0]
# 將nx.Graph形式的圖轉(zhuǎn)換成PyG需要的格式
graph = to_networkx(data)
data = from_networkx(graph)
# 獲取節(jié)點數(shù)量和特征向量維度
num_nodes = data.num_nodes
num_features = dataset.num_features
num_classes = dataset.num_classes
# 建立需要訓(xùn)練的節(jié)點分割數(shù)據(jù)集
data.train_mask = torch.zeros(num_nodes, dtype=torch.bool)
data.val_mask = torch.zeros(num_nodes, dtype=torch.bool)
data.test_mask = torch.zeros(num_nodes, dtype=torch.bool)
data.train_mask[:num_nodes - 1000] = True
data.test_mask[-1000:] = True
data.val_mask[num_nodes - 2000: num_nodes - 1000] = True

實現(xiàn)模型

接下來，我們需要定義GIN模型。

from torch_geometric.nn import global_mean_pool
class GIN(torch.nn.Module):
    def __init__(self, hidden_dim, num_layers):
        super(GIN, self).__init__()
        self.conv1 = GINConv(mlp=nn.Sequential(nn.Linear(num_features, hidden_dim),
                                                nn.ReLU(),
                                                nn.Linear(hidden_dim, hidden_dim)))
        self.convs = nn.ModuleList()
        for _ in range(num_layers - 1):
            self.convs.append(GINConv(mlp=nn.Sequential(nn.Linear(hidden_dim, hidden_dim),
                                                        nn.ReLU(),
                                                        nn.Linear(hidden_dim, hidden_dim))))
        self.classify = nn.Sequential(nn.Linear(hidden_dim, num_classes))
    def forward(self, data):
        x, edge_index, batch = data.x, data.edge_index, data.batch
        x = F.relu(self.conv1(x, edge_index))
        for conv in self.convs:
            x = F.relu(conv(x, edge_index))
        out = global_mean_pool(x, batch)
        return self.classify(out)

在上述代碼中，我們實現(xiàn)了多層GIN的“可重復(fù)均值池化”結(jié)構(gòu)，并使用MLP作為轉(zhuǎn)換函數(shù)進行多層特征提取。

模型訓(xùn)練

定義好模型后，可以開始針對Cora數(shù)據(jù)集進行模型訓(xùn)練了。訓(xùn)練模型前先設(shè)置好優(yōu)化器和損失函數(shù)，并指定訓(xùn)練周期及其過程中需要記錄輸出信息的參數(shù)。

from torch_geometric.nn import GINConv, global_add_pool
# 初始化GIN并指定參數(shù)
num_layers = 5
hidden_dim = 1024
model = GIN(hidden_dim=hidden_dim, num_layers=num_layers).to(device)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.001, weight_decay=1e-06)
loss_func = nn.CrossEntropyLoss()
# 開始訓(xùn)練
for epoch in range(100):
    model.train()
    optimizer.zero_grad()
    pred = model(train_data)
    loss = loss_func(pred[train_mask], train_labels)
    loss.backward()
    optimizer.step()
    # 在各個測試階段檢測一下準(zhǔn)確率
    with torch.no_grad():
        model.eval()
        pred = model(test_data)
        test_loss = loss_func(pred[test_mask], test_labels).item()
        pred = pred.argmax(dim=-1, keepdim=True)
        correct = float(pred[test_mask].eq(test_labels.view(-1, 1)[test_mask]).sum().item())
        acc = correct / test_mask.sum().item()
        if epoch % 10 == 0:
            print("Epoch {:03d}, Train Loss {:.4f}, Test Loss {:.4f}, Test Acc {:.4f}".format(
                epoch, loss.item(), test_loss, acc))

以上就是Pytorch+PyG實現(xiàn)GIN過程示例詳解的詳細(xì)內(nèi)容，更多關(guān)于Pytorch PyG實現(xiàn)GIN的資料請關(guān)注腳本之家其它相關(guān)文章！

您可能感興趣的文章: