Python如何用字典完成匹配任務(wù)
更新時(shí)間：2024年09月13日 09:34:18 作者：小豬崽子～
在生物信息學(xué)領(lǐng)域,經(jīng)常需要根據(jù)基因名稱匹配其對(duì)應(yīng)的編號(hào),本文介紹了一種通過(guò)字典進(jìn)行基因名稱與編號(hào)匹配的方法,首先定義一個(gè)空列表存儲(chǔ)對(duì)應(yīng)編號(hào),對(duì)于字典中不存在的基因名稱,其編號(hào)默認(rèn)為0
1. 問(wèn)題描述
如下左圖為編號(hào)與gene名稱的對(duì)應(yīng)關(guān)系（此處僅顯示前10條），已存為字典（map_gene）
右圖為我們需要去匹配的gene名稱，如何根據(jù)基因名稱給出對(duì)應(yīng)的編號(hào)？
2. 解決方案
2.1 定義變量
首先，我們定義一個(gè)空的list來(lái)存儲(chǔ)gene對(duì)應(yīng)的編號(hào)，且因部分gene在字典map_gene中不存在，故需記錄可匹配到的個(gè)數(shù)。
# 定義變量 m = [] # 存儲(chǔ)對(duì)應(yīng)編號(hào)的list t = 0 # 記錄map_gene中可以匹配到的gene個(gè)數(shù) n = 0 # 記錄map_gene中不存在的gene個(gè)數(shù)
2.2 匹配gene對(duì)應(yīng)的編號(hào)
# 遍歷gene列表，若在map_gene中可匹配到，則保存對(duì)應(yīng)編號(hào)；否則返回0.
for i in range(len(gene)):
if gene[i] in map_gene.keys():
m.append(map_gene[gene[i]])
t = t+1
else:
m.append(0)
n = n+12.3 將匹配好的結(jié)果導(dǎo)出存為csv格式
# 導(dǎo)出到csv
data = np.vstack(gene,m)
df = pd.DataFrame(data)
df.to_csv('gene_match.csv')csv文檔截圖如下，僅選取0-20gene展示結(jié)果，其中第18個(gè)gene rutr在gene_map中無(wú)匹配，故編號(hào)為0.
總結(jié)
匹配成功，撒花完結(jié)。
以上為個(gè)人經(jīng)驗(yàn)，希望能給大家一個(gè)參考，也希望大家多多支持腳本之家。
相關(guān)文章
Python中splitlines()方法的使用簡(jiǎn)介
這篇文章主要介紹了Python中splitlines()方法的使用簡(jiǎn)介,是Python入門中的基礎(chǔ)知識(shí),需要的朋友可以參考下2015-05-05
在本篇文章里小編給大家整理的是一篇關(guān)于python引入其他文件夾下的py文件具體方法，有興趣朋友們可以跟著學(xué)習(xí)參考下。2021-05-05
python3+RobotFramework環(huán)境搭建過(guò)程
之前用的python2.7+robotframework進(jìn)行的自動(dòng)化測(cè)試,python3的還沒(méi)嘗試,今天嘗試了下,搭建環(huán)境的時(shí)候也是各種報(bào)錯(cuò),今天給大家分享下python3+RobotFramework環(huán)境搭建過(guò)程,感興趣的朋友一起看看吧2023-08-08
Jmeter如何使用BeanShell取樣器調(diào)用Python腳本
這篇文章主要介紹了Jmeter使用BeanShell取樣器調(diào)用Python腳本,文章圍繞Jmeter調(diào)用Python腳本的相關(guān)詳情展開(kāi)標(biāo)題內(nèi)容，需要的小伙伴可以參考一下2022-03-03
本文主要介紹了numpy中np.c_和np.r_的用法解析，文中通過(guò)示例代碼介紹的非常詳細(xì)，對(duì)大家的學(xué)習(xí)或者工作具有一定的參考學(xué)習(xí)價(jià)值，需要的朋友們下面隨著小編來(lái)一起學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)吧2023-03-03
calendar在python3時(shí)間中常用函數(shù)舉例詳解
這篇文章主要介紹了calendar在python3時(shí)間中常用函數(shù)的相關(guān)文章，對(duì)此知識(shí)點(diǎn)有興趣的朋友們可以學(xué)習(xí)下。2020-11-11
在Python中，集合(Set)?是一個(gè)無(wú)序、不重復(fù)的序列，它不支持索引。本文將通過(guò)示例為大家詳細(xì)講講Python中集合是使用，需要的可以參考一下2022-09-09
Python numpy實(shí)現(xiàn)數(shù)組合并實(shí)例(vstack,hstack)
這篇文章主要介紹了Python numpy實(shí)現(xiàn)數(shù)組合并（官網(wǎng)實(shí)例），涉及vstack,hstack的簡(jiǎn)單用法，具有一定借鑒價(jià)值,需要的朋友可以參考下2018-01-01
python 遞歸深度優(yōu)先搜索與廣度優(yōu)先搜索算法模擬實(shí)現(xiàn)
這篇文章主要介紹了python 遞歸深度優(yōu)先搜索與廣度優(yōu)先搜索算法模擬實(shí)現(xiàn) ,非常不錯(cuò)，具有一定的參考借鑒價(jià)值，需要的朋友可以參考下2018-10-10
目前網(wǎng)絡(luò)上大多為用C++或者M(jìn)atlab編寫實(shí)現(xiàn)位圖分割，所以本文將使用Python實(shí)現(xiàn)位圖分割這一效果，代碼簡(jiǎn)單易懂，感興趣的小伙伴可以關(guān)注一下2021-11-11