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shelxtl (晶體結(jié)構(gòu)解析工具) 64位/32位 V2017 中文安裝版

  • 軟件大?。?span>20MB
  • 軟件語言:英文軟件
  • 軟件類型:國外軟件
  • 軟件授權(quán):免費(fèi)軟件
  • 軟件類別:其它行業(yè)
  • 應(yīng)用平臺:Windows平臺
  • 更新時(shí)間:2017-09-07
  • 網(wǎng)友評分:
360通過 騰訊通過 金山通過

情介紹

 shelxtl 64位/32位是一款功能強(qiáng)大的解晶體軟件。軟件包含XPREP,XS,XP,XL,XCIF五大程序,采用精確地分析計(jì)算技術(shù),可以幫助用戶快速分析晶體的結(jié)構(gòu)和詳細(xì)數(shù)據(jù),比較專業(yè)的一款軟件,推薦有需要的朋友可以來下載shelxtl 64位/32位中文版!

常用命令

一、選擇原子或(Q)峰的方法

1.光標(biāo)指在欲選擇位置,點(diǎn)S鍵,可依次選擇所有的要選擇的原子或Q峰

2.光標(biāo)指在欲選擇位置,右手鍵點(diǎn)“Select”,可依次選擇原子

3.用Select菜單(或背景右手鍵點(diǎn)“Select”)可選擇部分和所有的原子或Q峰,順序與原順序相同

4.按住“Shift”鍵,左手鍵拖出一個(gè)選擇框并同時(shí)輕開,可選擇一個(gè)或多個(gè)原子

5.點(diǎn)refine菜單,系統(tǒng)會提示有Q峰沒命名,并選擇所有Q峰,順序與原來順序相同

二、刪除原子或(Q)峰的方法

1.光標(biāo)指在欲刪除位置(原子或鍵),點(diǎn)K鍵

2.光標(biāo)指在欲刪除位置,右手鍵點(diǎn)Bonds and Angles,再在對話框中點(diǎn)“Delete”

3.光標(biāo)指在欲刪除位置,右手鍵點(diǎn)“Delete”

4.先選擇,再點(diǎn)Select菜單中的Kill selected e在ins文件刪除

三、恢復(fù)刪錯(cuò)的原子或(Q)峰的方法

點(diǎn)“Edit>Restore Killed Atom”,先選擇要恢復(fù)的原子(或Q峰),再點(diǎn)“Restore”

四、命名(標(biāo)記)原子或(Q)峰的方法

1.先選擇,再用Lablels菜單中的Group label

2.光標(biāo)指在要命名的位置,用右手鍵的Edit

3.光標(biāo)指在欲命名位置,右手鍵點(diǎn)Bonds and Angles,再在對話框中點(diǎn)“Rename”

軟件功能

1、數(shù)據(jù)校正-SADABS

SMART CCD由于設(shè)備的特殊性使得它不具有四圓一樣的PSI校正(由于晶體外觀的不對稱性),但由于在CCD所收集的數(shù)據(jù)中有很多對的等效點(diǎn),因而也可擬合出一條經(jīng)驗(yàn)校正曲線。SADABS就是Sheldrick特別為CCD數(shù)據(jù)編寫的校正程序。由于SADABS使用等效點(diǎn),因而要求輸入正確的Laue群,只有正確的Laue群才能保證校正的正確性。

SADABS還提供了與θ有關(guān)的校正——所謂的球形校正,它的原理就是在不同的θ角衍射時(shí),X射線通過的光程不同,因而吸收也不同,該校正要求μR值,其中R為晶體幾何尺寸中最小的邊長,而晶體的吸收因子μ是由化合物的分子式?jīng)Q定的,因而只有在結(jié)構(gòu)完全解釋出來之后才能進(jìn)行這個(gè)校正,而這種校正目前有些刊物是要求提供的。也正因?yàn)槿绱?,要求保留最原始的?shù)據(jù)文件*.RAW。

2、數(shù)據(jù)處理-XPREPXPREP主要完成數(shù)據(jù)處理工作,它要求存在RAW或HKL文件,它的使用命令是:

Xprep name它是一個(gè)交互式菜單驅(qū)動(dòng)程序并提供了一個(gè)缺省運(yùn)行過程:

1.從name.hkl文件(若存在)或name.raw文件中讀入衍射點(diǎn)

2.從name.p4p或鍵盤獲得單胞參數(shù)及誤差;

3.判斷晶格類型3、尋找最高對稱性

單胞參數(shù)只是晶體對稱性的外在表現(xiàn)形式,衍射點(diǎn)的對稱才是晶體對稱性的內(nèi)在表現(xiàn)。雖然SMART中也對晶格類型進(jìn)行判斷,但由于CCD中搜尋衍射點(diǎn)的對稱性的代價(jià)較為昂貴,通常在收集數(shù)據(jù)時(shí)不檢測衍射點(diǎn)的對稱性,這樣導(dǎo)致在收集數(shù)據(jù)時(shí)所判斷的對稱性不準(zhǔn)確,而且由于此時(shí)進(jìn)行指標(biāo)化的衍射點(diǎn)未必很好,導(dǎo)致某些軸之間的偏差比設(shè)定的偏差大從而不能得到真正的對稱性,即使選定的對稱性比實(shí)際的對稱性要低。而在SAINT以大量的衍射點(diǎn)精修單胞參數(shù)之后,單胞參數(shù)趨向真實(shí)值,此時(shí)再對單胞參數(shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)化,可以更準(zhǔn)確地得到晶體的對稱性。4、確定空間群

XPREP按照選定的晶系,晶格類型,E值統(tǒng)計(jì),消光特點(diǎn)來判斷空間群,并給出了可能的空間群及其對應(yīng)的綜合因子CFOM,CFOM越小,空間群的可能性越大,一般CFOM小于1表明建議的空間群很大可能是正確的,而CFOM大于10則表明可能是錯(cuò)誤的,通常CFOM小于10的空間群是可以接受的5、輸入分子式

SHELXTL在進(jìn)行結(jié)構(gòu)解釋時(shí),分子式并不十分重要,重要的只是原子的種類,當(dāng)然在有有機(jī)基團(tuán)存在的情況下只提供原子種類是難以進(jìn)行結(jié)構(gòu)解釋的,必須提供有機(jī)基團(tuán)的結(jié)構(gòu)類型,最簡單的例子:六元環(huán)可能是苯環(huán),也可能是吡啶環(huán)甚至其它的環(huán),若不知基團(tuán)類型是無法解釋的。但在產(chǎn)生結(jié)構(gòu)報(bào)表時(shí)還是需要準(zhǔn)確的分子時(shí),甚至在進(jìn)行與θ有關(guān)的校正時(shí)也需要準(zhǔn)確的分子式。

在輸入原子種類之后,XPREP將產(chǎn)生name.ins及name.hkl文件,到此完成數(shù)據(jù)處理工作。

6、結(jié)構(gòu)解釋——XS除非有異質(zhì)同晶的化合物結(jié)構(gòu)(可以套用它的結(jié)構(gòu)),否則任何化合物的結(jié)構(gòu)解釋都必須對結(jié)構(gòu)進(jìn)行初解釋。SHELXTL中XS可通過①直接法;②Patterson法;③碎片法對結(jié)構(gòu)進(jìn)行解釋,它的運(yùn)行命令如下:

xs name

它要求存在name.ins及name.hkl兩個(gè)文件,并將產(chǎn)生name.res文件,在name.res文件中,XS自動(dòng)按照所給的原子種類把最強(qiáng)的峰命名為最重的原子,并把后續(xù)的峰按照其強(qiáng)度進(jìn)行可能的命名,同時(shí)還進(jìn)行結(jié)構(gòu)修正,產(chǎn)生更多的差Fourier峰。在某些情況下XS結(jié)果是極其準(zhǔn)確的,它可以直接得到大部分結(jié)構(gòu)(直接法),而這些結(jié)構(gòu)在后續(xù)的差Fourier峰中都未必看的更清楚。表征直接法質(zhì)量的參數(shù)有:CFOM及RE,它們越小表明直接法越成功,通常情況下CFOM在0.1,RE在0.3以下表明直接法可能是成功的。

但直接法也有其局限性,特別是對于那些單斜晶系有心空間群,此時(shí)可把空間群降低成無心結(jié)構(gòu)但要記住最后必須把它還原成有心結(jié)構(gòu),或者可使用Patterson法。在有超過Na的重原子存在的條件下,Patterson法可以給出較好的結(jié)果,但Patterson不進(jìn)行結(jié)構(gòu)修正,也沒有很好的表征參數(shù)。

菜單解釋

[D]Read,Modify or Merge DATDSETS 讀入、更改、合并衍射數(shù)據(jù)

[P]Contour PATTERSON Secions 計(jì)算顯示Patterson截面

[H]Search for HIGHER mertric symmetry 尋找更高的對稱性

Determine or input SPACE GROUP 確定或輸入已知的空間群

[A]Apply ABSORPTION corrections 吸收校正

[M]Test for MEROHEDRAL TWINNING孿晶缺面試驗(yàn)

[L]Reset LATTICE type of Original Cell重設(shè)原始晶胞的晶格類型

[C]Define unit-cell CONTENTS定義單胞的化學(xué)組成

[F]Setup SHELXTL FILES建立計(jì)算指令文件

[R]RECIPROCAL Space Displays顯示倒易空間

UNIT-CELL transformations轉(zhuǎn)換晶胞

[T]Change TOLERANCES改變一些變量的容忍值

[O]Self-rotaion function自旋函數(shù)

[Q]Quit Program退出程序

載地址

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shelxtl (晶體結(jié)構(gòu)解析工具) 64位/32位 V2017 中文安裝版

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