bioedit(分子生物學(xué)應(yīng)用軟件)是一款功能非常齊全的分子生物學(xué)應(yīng)用軟件，bioedit可以幫助用戶對核苷酸序列，蛋白質(zhì)序列等進行所有的常規(guī)的分析操作，比如引物設(shè)計、序列比對、系統(tǒng)發(fā)育分析等，軟件和dnaman比較的話，它的分析內(nèi)容相對要比dnaman豐富許多，并且還為用戶提供了許多的網(wǎng)絡(luò)程序的接口，分析界面等，本次帶來bioedit漢化版免費下載，需要的朋友千萬不要錯過！

軟件簡介：

BioEdit是一個功能齊全的免費序列對比編輯器軟件。對于分子生物學(xué)來說，是一款相當(dāng)不錯的應(yīng)用工具了。主要可以完成核苷酸序列和蛋白質(zhì)序列進行所有常規(guī)的分析操作，如：序列比對、序列檢索、引物設(shè)計、系統(tǒng)發(fā)育分析等。這是由研究生設(shè)計和編寫的鼠標(biāo)驅(qū)動的，所以對于序列比對編輯器和序列分析程序，非常易于使用。而且他們深入理解如何依靠文字處理器和命令行程序進行序列操作。 提供了一個單一的程序，可以處理大多數(shù)簡單的序列和比對編輯和操作功能，研究人員可能每天都會做，以及一些基本的序列分析。所以說，對于生物DNA序列分析來說，非常的有用。覺得需要的朋友，可以下載使用哦！

特色介紹：

1、可以完全核苷酸序列和蛋白質(zhì)序列進行所有常規(guī)的分析操作

2、序列比對、序列檢索、引物設(shè)計、系統(tǒng)發(fā)育分析等

3、和DNAMAN 相比其分析內(nèi)容相對更豐富一些

功能說明：

1、手動對齊四種模式：選擇和幻燈片，動態(tài)抓取和拖動，間隙插入和鼠標(biāo)點擊刪除，以及在屏幕上的打字行為就像一個文本編輯器。

2、獨立核酸和氨基酸顏色表的顏色對齊和編輯，并完全控制背景顏色。

3、用于從DNA序列自動生成質(zhì)粒載體圖的質(zhì)粒繪圖接口。輕松標(biāo)記位置，添加箭頭和彎曲框的功能，并標(biāo)記限制性酶切位點。同時顯示polylinker的細節(jié)，繪制可移動的箭頭和繪圖工具的形狀。

4、動態(tài)的基于信息的對齊陰影。

5、點擊顏色表編輯

6、顯示和打印具有專業(yè)外觀的ABI色譜圖。

7、將序列分組成組或族。

8、為同步手對齊調(diào)整鎖定分組序列的對齊。

9、在包含特征注釋信息工具提示的對齊窗口中使用動態(tài)視圖對具有圖形特征的序列進行注釋。

10、鎖定序列以防止意外編輯。

11、在氨基酸和核苷酸序列中指定被認(rèn)為有效的字符進行計算。

12、按照名稱，LOCUS，定義，訪問，PID / NID，參考，注釋或選定列中的殘留頻率對序列進行排序。

13、通過參考序列合并對齊。

14、追加一個對齊到另一個的結(jié)尾。

15、基本的系統(tǒng)發(fā)育樹查看器（phylip格式樹），允許節(jié)點翻轉(zhuǎn)和打印。

16、在單個序列編輯器中用字母讀回序列來驗證手工輸入的序列條目。

17、讀寫Genbank，F(xiàn)asta，Phylip 3.2，Phylip 4和NBRF / PIR格式?，F(xiàn)在還讀取GCG和Clustal格式

18、利用Don Gilbert的ReadSeq自動導(dǎo)入和導(dǎo)出另外11種格式，包括MSF，ASN.1，IG / Stanford和EMBL。

19、允許直接從剪貼板導(dǎo)入兼容格式，而不先保存到文件。

20、輕松定制編輯器窗口的菜單快捷鍵

21、RNA比較分析，包括協(xié)變，潛在配對和互信息分析（目前能夠生成矩陣高達10,000 x 10,000 - 但這將是一個600 + Mb文件）與矩陣?yán)L圖儀的二維矩陣輸出表和面積圖數(shù)據(jù)矩陣的單獨行。矩陣?yán)L圖儀和線圖都具有點擊數(shù)據(jù)選擇，矩陣數(shù)據(jù)的矩陣?yán)L圖儀和一維線圖現(xiàn)在是動態(tài)鏈接的

漢化說明：

先行安裝原英文版軟件，再安裝本簡體中文包后運行主程序即可!

本簡體中文語言包是在7.0.1基礎(chǔ)上漢化的，同時也可以使用于各個版本的BioEdit。因采用外掛語言包形式，故軟件中仍有不少地方顯示為英文。

bioedit序列拼接教程：

1、在BioEdit中開啟一個序列

2、而后將序列上方的一個菜單：Mode下拉式菜單改為Edit，將光標(biāo)移動到序列的最末端，從粘貼板上粘貼你要增加的第二個序列就OK了。這樣三個序列都前后連接到一起了。

3、這需要一個一個來，十分麻煩。Mega5軟件支持將比對后的序列一下子全部放到此外一個比對后的序列后面。因此在序列連接(或拼接)中，用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做連接時，要選擇Edit/Build alignment，不能是Edit/view選項，不然不能編輯。

Bioedit軟件使用教程開啟Bioedit軟件，F(xiàn)ileOpen，開啟上述比對后的fasta文件，即本例的123.fasta。模式(Mode)選擇Edit，Overwrite;選擇修改模式為右鍵插入，即I圖標(biāo)。對序列堿基進行編輯。刪除序列使用鍵盤上的-鍵。編輯完成后，刪除參考序列文件。

文件輸出

點擊FileSave As，保存為fasta格式，本例保存為123.fasta，覆蓋舊文件。

怎么利用bioedit做序列的比較？

利用bioedit做序列比較

而且提供了很多網(wǎng)絡(luò)程序的分析界面和接口

首先要把所有的序列復(fù)制到windows自帶的記事本中，全部以fasta格式存到同一個文件中，保存成*.txt，序列內(nèi)部最好不要有空格或者換行。

序列格式舉例如下：

“>序列1 ATCG..........ATCG

>序列2 ATCG..........ATCG

>序列3 ATCG..........ATCG

>序列4 ATCG..........ATCG”

然后用Bioedit打開剛才保存的文件*.txt，點擊窗口上方的Accessory application菜單，再點擊clustelW multiple alignment，這時候會彈出一個窗口，直接選擇Run clustalW，又彈出一個窗口，選擇ok，等待結(jié)果就行了。

最后的比對結(jié)果可以保存成*.fas格式，適用于各種分析。