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怎么免費注冊安裝BioSolveIT infiniSee?分子對接對接軟件使用教程

  發(fā)布時間:2023-11-03 07:50:05   作者:佚名   我要評論
如何安裝注冊BioSolvetIT infiniSee?BioSolveIT infiniSee是一款強大的分子對接軟件,它用于預測小分子和生物大分子之間的相互作用,這種相互作用通常在藥物發(fā)現和設計過程中進行預測和分析,infiniSee使用先進的分子對接算法,可以快速、準確地預測小分子

BioSolvetIT infiniSee安裝注冊教程!BioSolvetIT infiniSee 是您的化學空間導航平臺。基于相似性,英菲尼發(fā)現分子感興趣的篩選庫或化學空間的無限大。給予模板或查詢分子,英菲尼的返回出人意料的相似分子.BioSolveIT infiniSee是一款強大的分子對接軟件,它用于預測小分子和生物大分子之間的相互作用。這種相互作用通常在藥物發(fā)現和設計過程中進行預測和分析。infiniSee使用先進的分子對接算法,可以快速、準確地預測小分子和生物大分子之間的相互作用。它支持多種輸入格式,包括PDB、SMILES和分子網絡等。此外,該軟件還具有強大的可視化功能,可以直觀地顯示小分子和生物大分子之間的相互作用,從而幫助研究人員更好地理解藥物與目標蛋白之間的相互作用。

在使用infiniSee時,用戶需要提供小分子和生物大分子的結構信息,并選擇適當的對接算法和參數。然后,軟件將執(zhí)行對接實驗并生成結果報告,包括小分子和生物大分子之間的相互作用細節(jié)、能量分析和動力學模擬等。這些結果可以幫助研究人員更好地理解藥物與目標蛋白之間的相互作用,從而優(yōu)化藥物設計和開發(fā)??傊珺ioSolveIT的infiniSee是一款強大的分子對接軟件,它可以幫助研究人員快速、準確地預測小分子和生物大分子之間的相互作用,從而優(yōu)化藥物設計和開發(fā)。

今天腳本之家小編給大家分享的是BioSolvetIT infiniSee的免費版本,下面有詳細的安裝注冊教程,需要的朋友不要錯過哦!

安裝教程

1.在腳本之家下載解壓后,大家將獲得infinisee-5.1.0-Win64.exe和crack等文件,雙擊infinisee-5.1.0-Win64.exe開始安裝軟件;點擊browse更換軟件安裝目錄,默認目錄:C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\BioSolveIT\infiniSee-5.1.0;如圖

2.默認選擇,點擊next,如圖

3.默認選擇,點擊next,如圖

4.等待安裝完成即可,如圖

5.點擊install開始安裝軟件,如圖

6.去掉運行軟件的勾選,先不要運行軟件,如圖

7.在安裝補丁前,首先要打開軟件的安裝目錄,如果忘記軟件的安裝目錄,請返回到桌面,找到軟件的桌面快捷圖標,并右鍵點擊圖標,出現彈窗后選擇“打開文件位置”即可獲得文件安裝目錄。如圖

8.打開crack文件,將里面的文件復制到軟件安裝目錄中替換,如圖

9.選擇替換目標中的文件,如圖

10.安裝激活完成,如圖

軟件簡介

讓我們先做一個思考實驗:如果你在奧運會大小的游泳池里裝滿沙子,你需要一個大約1,000,000,000杯咖啡。這個體積大約含有1013粒沙?!,F在,想想這些沙粒代表可能的藥物候選人,你正在尋找一個黃金分子。高通量虛擬篩選通常涉及大約5到1千萬種化合物,這與在5到10杯沙子中尋找一種特定的顆粒是相同的。但是誰能保證完美的分子在你從泳池里取出的5-10個杯子中的一個呢?可能性最多也就是一百萬分之一。..如果你能在整個游泳池甚至數以千計的游泳池中搜索,難道不是更好、更有希望嗎?

功能特色

發(fā)現看不見的可能性

在1014個結構和更多的前所未有的大空間中找到分子,或者在你自己的內部庫中搜尋活躍分子。

相似之處

查詢和點擊分子之間的相似性是令人愉快的可視化,你可以毫不費力地選擇化合物。英菲尼將向你展示為什么它認為某些東西是相同的。

鄰居與遙遠的鄰居在一起

我的復合庫有趣的腳手架跳。在一見鐘情中發(fā)現了距離遙遠的分子,但在化學和基于藥物的作用中非常接近。

無限的可獲得性

幾天內從虛擬到小瓶!只有極有可能在實驗室中形成的東西才會在英菲尼的化學空間導航中提出。與我們的合作伙伴合作,可以在幾周內提供所需的點擊率。

找出隱藏的相似之處

有了英菲尼,你終于可以比較蘋果和桔子了。英菲尼的基本概念非常簡單:我們不是搜索已經"組裝"的分子,而是從"碎片"中組合合成化合物。碎片的來源可以是組合庫,也可以是任何產生碎片的過程。英菲尼打開了通過相似性搜索技術篩選數十億種化合物的可能性,方法是在廣闊的化學空間中導航,并搜索一個查詢分子的遠鄰。結果通常在不到一分鐘的時間內就會在標準筆記本電腦上發(fā)布。您可以選擇定義模糊的藥物,以增加支架的多樣性,或要求重要的分子結構在點擊。

你的分子可以在任何地方

英菲尼斯特巧妙的扭轉不僅是在巨大的化學空間中進行搜索的可能性,而且是在不同來源的空間中搜尋的可能性。不同空間的相同結構的數目極低(萊塞爾等人)。由于空間的設計和設置,以及所使用的建筑物的多樣性。不管你的內部庫有多大,也不管你獲得了多少化合物來添加,它只會是你的化學家合成能力的一小部分。涉及不同的化學空間增加了你找到你本來會錯過的分子的機會。

速藍色

以前所未有的速度穿越廣闊的化學空間。

視覺藍色

用直覺的色彩編碼,在一睹中理解相似性。

易藍的

自我解釋接口。簡單地拖動您的查詢并開始。

更新說明

與貝姆斯-穆爾克科腳手架和骨架的復合聚類: 在分析器模式中引入了Bemis-Murcko支架生成方法,通過將數據抽象到分子及其核心結構之間的關系,快速簡化了大型數據集。計算了兩種表示形式,即Bemis-Murcko支架和骨架。

腳手架和骨架既可以在單個分子上產生,也可以在分析器模式表中的一組被檢查的分子上產生:

在單個分子上,右擊分子入口,然后單擊相應的支架/骨架計算選項。

對于多個檢查過的分子,將使用新引入的"檢查過的分子計算"工具欄按鈕,并選擇適當的選項。

基于支架或骨架的分子分組可以在數據面板中通過在"可視化"下拉菜單下引入的多個新選項中選擇一個來完成。

有關貝姆斯-穆爾科腳手架和骨架的信息也包含在從英菲尼塞導出的elel、CSV和Sdf文件中。

網格視圖現在是支架、骨架和試劑可視化的默認值。

單一或多個檢查過的腳手架/骨架可用作過濾器,將數據縮小到僅包含特定腳手架或骨架的數據。

在單個條目上,右擊腳手架/骨架條目,然后單擊"創(chuàng)建過濾器"選項,最后確認篩選器面板中的篩選參數。

對于多個檢查過的條目,單擊數據面板左上角的篩選按鈕,將選擇檢查過的條目作為篩選參數。根據選定的條目設置篩選器在篩選器面板中按慣例進行。

增強模擬獵人: 模擬搜索現在還生成了二維面板上的查詢結果匹配圖像,提供了相似性的視覺和直觀指示。

模擬獵手中的查詢現在可以包含宏觀循環(huán),只要搜索的化學空間中含有具有宏觀循環(huán)的化合物,就會提供有意義的結果。 注: 生物分子提供的化學空間不包含有大循環(huán)的分子,但是如果用戶用大循環(huán)創(chuàng)造自己的空間,那么相應的結果就應該被發(fā)現。此外,支架料斗仍然不能接受大循環(huán)分子作為輸入。

具有宏觀循環(huán)的分子也可以被加載到分析器模式中進行進一步的處理。

更快的腳手架斗和模擬獵人搜索: 在腳手架料斗中的搜索現在比以前更快,這是因為下面的富奇版本從6.9更新到6.10。

通過模擬獵手進行的近距離模擬搜索現在比以前快得多,這是因為空間光算法從1.1版更新到1.2版。

新模式預覽,模式選擇器行為: 一個新的搜索模式的無功能預覽 "主題組合者" 用于超大組合化學空間的子結構搜索。

模式選擇器面板現在根據用戶設置的屏幕大小或英菲尼塞窗口的大小動態(tài)調整大小。

供應商特有的分子分組和過濾: 現在可以根據相應的供應商使用數據面板中的"供應商的分子"下拉菜單項對分析器中來自支架斗或模擬獵手搜索的分子進行分組。

復合供應商可以作為篩選標準,以縮小分析器模式中的數據范圍,僅限于那些由用戶選擇的供應商。

試劑可視化網格視圖: 除了表視圖之外,為了有效地利用篩選一個化學空間,在"分子按試劑"菜單項下介紹了分析器模式數據面板中試劑的網格視圖。

加強對計算的控制: 在系統(tǒng)設置中,引入了一個新的"計算"選項(類似于SEEES)。

用戶可以決定他們是否希望在下列工作流程下自動計算出Bemis-Morcko腳手架/骨架和優(yōu)化屬性:

從文件中裝載分子

從搜索模式向分析器添加分子

改進與直方圖的相互作用: 使用直方圖框作為篩選標準現在額外的可能性與右擊在垃圾箱上。

拿著換檔鍵,選擇兩個不相鄰的垃圾箱,選擇范圍內的所有垃圾箱作為過濾器。

鍵盤快捷鍵: 在數據面板中檢查和取消檢查項現在可以使用ALT+C鍵盤快捷鍵。這種快捷方式對表格和網格視圖都有效

通知行為的變化: 從英菲尼版本5.1,只有關鍵通知(帶有紅色背景)將保留在屏幕上供用戶操作。

所有其他非臨界通知(橙色背景)和信息(藍色背景)在屏幕上顯示一段短時間后,將會折疊到消息中心堆棧中。

雜項變動:

在分析器模式下,指向數據面板中"選擇可視化"下拉菜單的泡沫幫助現在只在分析器表中有數據時顯示。

參數#立體聲中心和#立體聲鍵已從分析器模式中刪除。

腳手架料斗生成的查詢結果匹配圖像將不包含在二維面板顯示的全局相似性。

如果用戶選擇的保存或創(chuàng)建項目的位置缺乏書面訪問,則顯示了信息錯誤消息。

當一個無效的許可證文件被拖放時,啟動屏幕現在提供清晰的視覺反饋

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