discovery studio 4.5 32位/64位 官方安裝免費版(附安裝教程)
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Accelrys Discovery Studio v2.5 官方免費安裝版(附安裝教程)
2.66GB / 09-13
詳情介紹
Discovery Studio 2021是一款功能非常強大的分子建模軟件,該軟件擁有的功能十分強大,支持模型構(gòu)型、模型分析、科學應(yīng)用、腳本編寫、圖像分析、藥理基團、蛋白質(zhì)建模、RL互動、序列分析、排序、模擬以及X射線等多種的功能,但是其主要的功能就是讓用戶能夠在編輯化學教材的時候擁有超多的模型和圖紙設(shè)計方案。它可以夠幫助用戶輕松進行各種分子建模的工作,甚至還有效的提升了用戶的角膜效率,從而讓分子的研究更加的高效。使用它,用戶可以通過高質(zhì)量的圖形、多年專業(yè)驗證的技術(shù)以及集成的環(huán)境,從而為用戶提供實驗數(shù)據(jù)保存、管理與專業(yè)水準的建模,這樣就可以提高我們用戶在建模上的效率。除此之外,Discovery Studio軟件在化學方面,是可以通過數(shù)據(jù)建立分子模型,甚至還可以分析多種實驗以及物體的結(jié)構(gòu),完全是支持生成模型輸出到打印機上;然后在生物分析方面,也是支持將不同的基因序列放到軟件上進行計算的,并且還可以以對比不同序列的變化,從而從而知道蛋白質(zhì)、DNA的實驗結(jié)果。
ps:今天小編為各位帶帶來的是Discovery Studio 2021破解版,附有破解補丁能夠完美的激活該軟件,下文還有十分詳細的圖文安裝教程,希望可以幫助到大家,有需要的朋友歡迎前來下載!
Discovery Studio 2021破解版安裝步驟:
1、在本站下載解壓文件,解壓得到Discovery Studio 2021原程序和破解補丁文件夾;
2、選擇“DS45Client.exe”開始安裝軟件,單擊“下一步”;
3、選擇自己的安裝路徑,
4、點擊安裝
5、安裝中,請稍候
6、將破解補丁復(fù)制到安裝路徑
7、至此;以上就是Discovery Studio破解版的全部安裝教程,大家可以免費使用。
軟件特色
1、可以將化學在這款軟件上展示出來
2、可以將數(shù)據(jù)通過模型以及圖像的方式展示
3、支持分子標簽制作,可以建立不同分子結(jié)構(gòu)
4、支持監(jiān)控變化,可以輸入一個變量查看分子變化
5、支持動畫樣式,對于設(shè)計化學模型,可以建立動畫反應(yīng)
6、支持表面處理,顯示分子模型的表面樣式
7、可以建立分子的半徑,方便您定義模型大小比例
8、也可以制作坐標,對于分析不同點的化學數(shù)據(jù)很有用
9、支持數(shù)據(jù)疊加功能,輕松添加數(shù)據(jù)到模型
Discovery Studio 2021使用方法
1、雙擊打開軟件,如下圖
2、進入軟件,顯示很多示例文件,這里可以點擊第一個Protein Structure蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)查看
3、如圖所示,這里就是蛋白質(zhì)的編輯樣式,如果你需要自己設(shè)計,可以從化學界面上找到模型
4、點擊Multiple sequence alignment功能,可以將您的多序列比對
5、提示一些關(guān)于DNA的子項目,可以點擊DNA-Single Strand查看鏈接,也可以查看不同的分子樣式
6、點擊Chemistry可以查看軟件的化學結(jié)構(gòu),可以分析立體化學模型
使用說明
圖形選項卡-圖形視圖顯示樣式對話框
“圖形視圖顯示樣式”對話框上的“圖形”選項卡允許您為當前“分子窗口”設(shè)置常規(guī)圖形屬性。該選項卡始終可用,并且在保存文件時,此處指定的設(shè)置將與其余數(shù)據(jù)一起保存。該窗口中的設(shè)置是通過“分子窗口” |“分子窗口”訪問的全局應(yīng)用程序設(shè)置的子集。圖形首選項頁面。
投影
這些選項使您可以設(shè)置兩種不同投影模式的分子顯示:
正交投影:正交投影可產(chǎn)生一個視圖,在該視圖中,對象與觀察者之間的距離無視其大小相同。正射投影通常用于工程圖形中,并具有更高的精度。
透視圖:透視圖投影會產(chǎn)生一個視圖,其中距離觀察者較遠的對象看起來比靠近觀察者的對象小。這類似于人眼觀察世界和照相機產(chǎn)生照片的方式。透視投影通常通過強調(diào)模型的深度而非大小來提供更真實的模型表示。
角度:透視角度控制透視投影中出現(xiàn)的縮短距離。較小的角度可減小透視度,而較大的角度可增大透視度。角度限制為1到120度之間的值。默認值為45.00°。
質(zhì)量
質(zhì)量設(shè)置控制用于顯示蛋白質(zhì)和DNA / RNA的3維對象的粗糙度。較低的質(zhì)量設(shè)置將通過增加粗糙度來改善渲染性能。較高的質(zhì)量設(shè)置可以改善視覺外觀。
對于常規(guī)使用,請選擇能夠最佳組合性能和質(zhì)量的設(shè)置。如果要導(dǎo)出圖像,請選擇“超高”以獲得最佳質(zhì)量。
背景顏色
這將打開“選擇顏色”對話框,您可以在其中選擇當前窗口的背景色。
其他選擇
線寬:控制用于以線顯示樣式和單元格邊界渲染對象(例如分子)的線的粗細。
深度提示:打開時,距離觀察者較遠的對象會逐漸融合到背景中,而靠近觀察者的對象將以完整,明亮的顏色顯示。通過更明亮地照亮附近的物體,而更遠的物體逐漸消失在黑暗中,此功能可以更好地感覺景深。關(guān)閉深度提示后,無論物體顏色與觀察者的距離有多遠,物體的顏色都將充滿而明亮。
原子選項卡-“圖形視圖顯示樣式”對話框
“ 圖形視圖顯示樣式”對話框上的“ 原子”選項卡控制原子和鍵的圖形表示。
展示風格
無:將選定的原子空白,使其不顯示在屏幕上。您可以使用這種樣式來簡化復(fù)雜的分子,方法是僅顯示感興趣的原子,或者在將蛋白質(zhì)顯示為條帶時隱藏原子。
線:使用傳統(tǒng)的線框顯示器顯示原子。未結(jié)合的原子顯示為插孔。
搖桿:使用實心圓柱體顯示粘結(jié)。非化學鍵原子顯示為千斤頂作為一個 線風格。的棒尺寸參數(shù)改變棒的厚度。
球和棒:使用圓柱體來描述鍵,原子來描述球。使用“ 球尺寸”和“ 桿尺寸”參數(shù)確定 球和桿的尺寸。
縮放的球和棒:使用圓柱體和原子進行鍵合,并使用縮放到范德華(VDW)半徑的球。使用“ 球尺寸”和“ 桿尺寸”參數(shù)確定球和桿的尺寸。您可以通過選擇化學|自定義每個元素的默認VDW半徑。菜單欄中的元素屬性...命令。
CPK:顯示大小與范德華(VDW)半徑相同的球。該CPK規(guī)模設(shè)定乘以VDW半徑由給定因素。您可以使用化學|自定義每個元素的默認VDW半徑。元素屬性...命令。
多面體:顯示原子周圍的配位多面體。這種樣式主要用于材料和無機分子。該多面體風格創(chuàng)建具有四個或更多債券的原子多面體。對聚合物的最終效果類似于鏈中的珠子。少于四個鍵的原子顯示為線,不顯示沒有鍵的原子。
染色
著色方式:您可以通過多種方式為原子著色。“ 顏色依據(jù)”列表具有多種預(yù)定義的配色方案,包括:
元素:使用為其元素定義的顏色為每個原子著色。您可以通過選擇化學|更改基本元素的顏色。菜單欄中的元素屬性...命令。
父色:通過包含原子的父對象的顏色為每個原子著色。例如,如果氨基酸中包含原子,則該原子被氨基酸的顏色著色。
分子顏色:通過原子所屬的分子的顏色為每個原子著色。
局部電荷:通過其局部電荷為每個原子著色。顏色是從紅色(帶負電荷)到藍色(帶正電荷)的漸變中獲取的。
<其他>:根據(jù)在分子上計算出的原子和分子屬性以及模型的層次結(jié)構(gòu),許多其他配色方案會自動添加到可用選項中。這些配色方案由包含原子的層次結(jié)構(gòu)中的分子對象命名,顏色基于模型中這些對象的數(shù)量。例如, 如果加載的蛋白質(zhì)包含多條鏈,則將Molecule,AminoAcidChain和AminoAcid方案添加到顏色選項中。如果您使用分子方案,則分子中的所有原子都是單一顏色(通常在文檔中只有一個分子)。如果您通過AminoAcidChain著色,一條鏈中的所有原子都著色為一種顏色,而第二條鏈中的所有原子均著色為另一種顏色。
注意。數(shù)據(jù)表中包含數(shù)字的任何列都可以用作顏色標準。
顏色...:此按鈕將啟動“ 顏色映射”對話框。
自定義:選擇單選按鈕,然后單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框。定義顏色后,單擊“ 應(yīng)用”按鈕或“ 確定”按鈕,將自定義顏色應(yīng)用于選定的原子。
僅碳原子:選中此框可將自定義顏色僅應(yīng)用于碳原子。
更多控制
顯示債券定單:此復(fù)選框控制多個債券的顯示方式是否與單個債券不同。該選項影響Line,Stick和Ball and Stick的顯示樣式。
球尺寸,棒尺寸,CPK比例:使用這些字段可自定義比例適當?shù)墓δ堋?/p>
蛋白質(zhì)選項卡-圖形視圖顯示樣式對話框
該蛋白質(zhì)的圖形視圖顯示樣式對話框中的選項卡允許您控制的氨基酸和氨基酸鏈的表示圖形視圖。
有幾種可用的表示方式,突出顯示了蛋白質(zhì)分子的關(guān)鍵特征,以允許檢查更高級別的結(jié)構(gòu)信息。
展示風格
關(guān):隱藏氨基酸或氨基酸鏈的顯示。
Ca絲:通過畫一條連接多肽分子中的α(α)碳原子的線來代表蛋白質(zhì)骨架。
鈣棒:通過畫一個連接多肽分子中的α(α)碳原子的圓柱體來代表蛋白質(zhì)骨架。
線帶:將蛋白質(zhì)骨架表示為緊密間隔的線帶。
扁平帶:將蛋白質(zhì)骨架表示為完全扁平的帶。
固體色帶:將蛋白質(zhì)骨架表示為固體3D色帶。
試管:與Ca Stick展示樣式相似,但可以使蛋白質(zhì)表達更為平滑。
示意圖:以卡通形式表示蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)基序。螺旋結(jié)構(gòu)表示為寬圓柱體,β折疊圖表示為指向C端方向的箭頭,而線圈和彎折區(qū)域表示為管。僅在未選擇或全部選擇蛋白質(zhì)時可用。
染色
上色方法:使用多種預(yù)定義的配色方案之一為氨基酸和氨基酸鏈著色。提供以下配色方案:
殘留物:對每個殘留物進行不同的著色。
CAlpha:根據(jù)殘基的C-alpha原子的顏色為殘基著色。
二級類型:根據(jù)二級結(jié)構(gòu)的顏色。螺旋是紅色的,β表是青色的,匝是綠色的,而線圈是白色的。
N到C端:以連續(xù)的梯度從N端的藍色到C端的白色到紅色對殘基進行著色。
AminoAcidChain:根據(jù)包含殘基的氨基酸鏈為殘基著色。
分子:根據(jù)包含殘基的分子對殘基進行著色。
單元格::根據(jù)包含殘基的單元格對殘基進行著色。如果模型中沒有單元格,則此選擇將不會出現(xiàn)在對話框中。
疏水性:為從紅色(負疏水性)到藍色的漸變上的殘基上色,以零的疏水性穿過白色。
pKa:根據(jù)pKa值著色殘留物。
平均 各向同性位移::根據(jù)構(gòu)成殘基的原子的平均各向同性位移為殘基著色。
ID:與N-to-C終端顏色方案相似,盡管使用此方案,您可以使用“ 顏色映射”對話框更改顏色圖。
色帶尺寸:根據(jù)殘留物指定的色帶尺寸為顏色著色。
可見:使用純色方案,而不參考上面列出的任何屬性。
數(shù)據(jù)表中包含的適當屬性會自動添加其他顏色方案 。這些方案通過將數(shù)據(jù)表中的相應(yīng)值映射到顏色來為氨基酸或氨基酸鏈著色。這些屬性的顏色映射可以使用“ 顏色映射”對話框進行修改 。
顏色...:此按鈕將啟動“ 顏色映射”對話框,該對話框控制顏色到數(shù)據(jù)表中值的映射。
自定義:使用單一顏色為氨基酸和氨基酸鏈著色。單擊顏色欄以顯示“ 選擇顏色”對話框,然后選擇一種顏色。
其他對話框控件
示尺寸:在文本框中輸入一個值以更改顯示結(jié)果的厚度。“ 顯示尺寸”選項僅對Ca Stick,Line,F(xiàn)lat Ribbon,Solid Ribbon和Tube顯示樣式啟用。通過選擇單個氨基酸,然后更改功能區(qū)大小屬性,可以更改單個殘基的顯示大小。
功能區(qū)大?。哼x中此選項可將“ 行功能區(qū)”,“ 扁平功能區(qū)”,“ 實心功能區(qū) ”或“ 管”顯示樣式的可見大小映射到內(nèi)置數(shù)字屬性或用戶定義的數(shù)字屬性。如果選擇“ 關(guān)閉”或“ Ca導(dǎo)線”顯示樣式,則“ 碳帶尺寸”選項不可用。
曲面選項卡-圖形視圖顯示樣式對話框
在“圖形視圖顯示樣式”對話框上的“ 表面”選項卡允許您顯示各種表面。
展示風格
從以下顯示表面選項中選擇:
關(guān):隱藏表面。
溶劑:溶劑表面類似于Connolly溶劑表面。此選項卡上的“ 探針半徑”設(shè)置控制用于描述表面的探針原子的大小。
柔軟:柔軟的表面類似于溶劑的表面,但是使用更快,更近似的算法。對于大分子,柔軟的表面具有更好的性能,因為它的繪制速度更快。
VDW: VDW表面基于分子中每個原子的范德華半徑。
注意。 刪除用于構(gòu)建曲面的原子后,將禁用“顯示樣式”單選按鈕,著色控件和“ 探針半徑”文本框。
表面渲染
固體:使表面固體(即不透明)。
絲網(wǎng):使曲面成為絲網(wǎng)。
探針半徑:顯示溶劑表面時,此值更改探針原子的大小。
透明/不透明:控制固體表面的透明度。向右移動滑塊可增加表面的不透明度,而向左移動則可增加透明度。
注意。將透明度級別設(shè)置為最大透明度將導(dǎo)致該表面消失并使其難以選擇。
背面:選中此框可啟用曲面背面的透明度控制。例如,您可以設(shè)置較高的表面透明度和較低的反面透明度,這將使您更好地看到表面的內(nèi)側(cè)。如果要使曲面的背面具有與正面相同的透明度,請取消選中此框。
染色
上色方式:從以下預(yù)定義樣式中進行選擇,以對蛋白質(zhì)表示進行著色:
父級顏色 -根據(jù)其父對象的顏色為表面著色
內(nèi)插電荷 -將內(nèi)插的部分原子電荷映射到表面
原子電荷 -將最近鄰的內(nèi)插部分原子電荷映射到表面
原子色 -將原子色映射到表面
注意。顏色標準不限于以上選項。數(shù)據(jù)表視圖中包含數(shù)字的任何列 都可以用作顏色標準。
圖例:切換顏色圖例的顯示。
顏色...:啟動“ 顏色映射”對話框。
按網(wǎng)格:選擇根據(jù)其特定網(wǎng)格為表面著色。
自定義:為表面分配自定義顏色。單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框。
自定義反面:為表面的反面分配自定義顏色,如果表面具有某些透明字符,則該顏色通過表面顏色顯示。單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框。
綁定站點選項卡-“圖形視圖顯示樣式”對話框
這種結(jié)合位點上的圖形視圖顯示樣式對話框選項卡僅當目前的結(jié)構(gòu)中含有的結(jié)合位點。
展示風格
關(guān):關(guān)閉綁定網(wǎng)站的顯示。
插孔:將綁定站點的每個點顯示為插孔。
球體:將綁定位置的每個點顯示為一個球體。
網(wǎng)格表面:將綁定位置的邊界顯示為網(wǎng)格表面。
固體表面:將結(jié)合位點的邊界顯示為固體表面。默認情況下,該表面是不透明的。
表面渲染
透明:如果選擇“ 實心”表面,請選擇此選項以使表面透明而不是不透明。
染色
上色方式:每個分區(qū)都有自己指定的顏色,選項包括:
點:每個點都有自己指定的顏色??梢允褂?ldquo; 視圖” |“點”單獨選擇點并為其著色。顏色...菜單命令。選擇此選項后,將重新應(yīng)用這些顏色。
站點:使整個站點成為單一顏色。
分區(qū):僅在上面選擇了分區(qū)時才可用。指定分區(qū)數(shù)。
自定義:允許您為綁定站點指定自定義顏色。單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框的“幫助”主題
等值面選項卡-圖形視圖顯示樣式對話框
僅當當前結(jié)構(gòu)包含一個或多個等值面時,“圖形視圖顯示樣式”對話框中的“ 等值面”選項卡才可用。此選項卡允許您更改從3D網(wǎng)格生成的等值面的顯示樣式。
展示風格
如果選擇了該選項,則結(jié)果說明如下。
關(guān):關(guān)閉等值面顯示。
實體:將等值面顯示為實體表面。激活此選項卡上的“ 透明度”滑塊控件。
三角形網(wǎng)格:將等值面數(shù)據(jù)顯示為劃分為三角形平面的金屬絲網(wǎng)。在此對話框上激活“ 線寬”控件。
四邊形網(wǎng)格:將等值面數(shù)據(jù)顯示為劃分為矩形平面的金屬絲網(wǎng)。在此對話框上激活“ 線寬”控件。
體積:使用選定的色譜圖顯示等值面數(shù)據(jù)。左下角的直方圖顯示數(shù)據(jù)分布和應(yīng)用于數(shù)據(jù)的頻譜。激活“ 頻譜”,“ 波段”,“ 透明度”滑塊控件和“ 剪切超出范圍”選項。
染色
按網(wǎng)格:加載從不同網(wǎng)格創(chuàng)建的兩個或多個曲面時,可以選擇此選項以顯示所有當前加載的網(wǎng)格的下拉列表。當“ 顯示樣式” 設(shè)置為“ 實體”,“ 三角形網(wǎng)格 ”或“ 四邊形網(wǎng)格”時,此選項可用。
顏色...:此按鈕將啟動“ 顏色映射”對話框。
自定義:您可以為Solid,Triangle網(wǎng)格和Quad網(wǎng)格顯示樣式分配自定義顏色。單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框。定義顏色后,單擊“ 應(yīng)用”按鈕或“ 確定”按鈕以接受您定義的自定義顏色。
自定義反面:如果等值面的顯示樣式設(shè)置為實心,則可以為等值面的反面分配自定義顏色。單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框并定義自定義反面顏色。
其他控制
等值線:更改實體,三角形網(wǎng)格和四邊形網(wǎng)格等值面顯示的幾何形狀。
線寬:當?shù)戎得骘@示為“ 三角形網(wǎng)格”或“ 四邊形網(wǎng)格”顯示時,控制線的粗細 。
直方圖:顯示文件中包含的等值面數(shù)據(jù)的范圍。移動直方圖左側(cè)和右側(cè)的兩個青色滑塊,以控制光譜的分布。左側(cè)滑塊下方的值被分配為最左側(cè)的顏色。右滑塊上方的值被分配為最右邊的顏色。如果選中了“ 超出范圍限制”選項,則這些值將不會顯示在“分子窗口”中。
顯示框:選中此選項將導(dǎo)致顯示等值面的邊界框。
光譜:包含可應(yīng)用于“ 體積 等值面”顯示的各種光譜。所選光譜顯示在直方圖的底部。
帶:頻譜控制是否顯示在2, 4,8,16,32,64,或128顏色的條帶。默認值為32。
透明度:控制體積等值面數(shù)據(jù)的透明度。向左滑動控件,使等值面顯示更加透明。向右滑動控件,使等值面顯示更加不透明。
剪輯超出范圍:當直方圖中的值受到限制時,控制等值面信息的顯示。取消選中此框時,超出范圍的值分別分配為最左側(cè)和最右側(cè)。選中此框時,根本不會顯示超出范圍的值。
更新日志Discovery Studio 2021更新日志
1、新的數(shù)據(jù)庫又得到了化學結(jié)構(gòu)復(fù)制的方案
2、可以從數(shù)據(jù)庫上找到分子方程式的變量數(shù)據(jù)
3、也可以自己將實驗的結(jié)果制作為研究模板
4、也可以針對不同類型的化學元素添加
5、支持使用電解質(zhì)方程插入到模型上
6、支持對分析的化學結(jié)果添加注釋信息
下載地址
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